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目的:通过网络药理学及分子对接技术研究萹蓄的主要活性成分,探讨其治疗尿路感染的作用机制.方法:运用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)收集萹蓄的有效成分和药物靶点,再通过人类基因数据库(GeneCards)找到疾病相关基因的靶点进行分析,对药物有效成分靶点和疾病靶点进行维恩(Venn)分析后得到二者的交集靶点,然后使用STRING数据库构建靶点蛋白互作(PPI)网络,通过R语言软件分析获得药物与疾病之间的交集靶点,使用Cytoscape 3.9.0软件绘制成分-靶点网络图,并在DAVID数据库中进行基因本体论(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路分析,最后进行活性成分及核心靶点的分子对接.结果:共筛选出6种主要化学成分,并确定了86个药物与疾病相对应的作用靶点.PPI网络发现雌激素受体1(ESR1)、白细胞介素-6(IL-6)、半胱氨酸蛋白酶3(CASP3)、V-Myc骨髓细胞瘤病毒癌基因同源物(MYC)、表皮生长因子受体(EGFR)、缺氧诱导因子1A(HIF1A)等关键靶点.分子对接结果表明,槲皮素与核心靶点IL6、MYC、CASP3、EGFR之间的结合能均≤-5 kcal/mol.结论:本研究初步验证了萹蓄治疗尿路感染的作用机制.研究表明,萹蓄具有多种成分和多种靶点,其作用机制具有多样性,对进一步研究萹蓄治疗尿路感染提供了参考.

作者:梁蒙蒙;刘子尧;任瑞民

来源:山西中医药大学学报 2023 年 24卷 6期

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作者:
梁蒙蒙;刘子尧;任瑞民
来源:
山西中医药大学学报 2023 年 24卷 6期
标签:
尿路感染 萹蓄 网络药理学 分子对接 作用机制 urinary tract infections Bianxu network pharmacology molecular docking mechanism of action
目的:通过网络药理学及分子对接技术研究萹蓄的主要活性成分,探讨其治疗尿路感染的作用机制.方法:运用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)收集萹蓄的有效成分和药物靶点,再通过人类基因数据库(GeneCards)找到疾病相关基因的靶点进行分析,对药物有效成分靶点和疾病靶点进行维恩(Venn)分析后得到二者的交集靶点,然后使用STRING数据库构建靶点蛋白互作(PPI)网络,通过R语言软件分析获得药物与疾病之间的交集靶点,使用Cytoscape 3.9.0软件绘制成分-靶点网络图,并在DAVID数据库中进行基因本体论(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路分析,最后进行活性成分及核心靶点的分子对接.结果:共筛选出6种主要化学成分,并确定了86个药物与疾病相对应的作用靶点.PPI网络发现雌激素受体1(ESR1)、白细胞介素-6(IL-6)、半胱氨酸蛋白酶3(CASP3)、V-Myc骨髓细胞瘤病毒癌基因同源物(MYC)、表皮生长因子受体(EGFR)、缺氧诱导因子1A(HIF1A)等关键靶点.分子对接结果表明,槲皮素与核心靶点IL6、MYC、CASP3、EGFR之间的结合能均≤-5 kcal/mol.结论:本研究初步验证了萹蓄治疗尿路感染的作用机制.研究表明,萹蓄具有多种成分和多种靶点,其作用机制具有多样性,对进一步研究萹蓄治疗尿路感染提供了参考.