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目的:应用DNA条形码技术对青海冬虫夏草和新疆虫草进行鉴别,考查ITS序列和18S序列作为DNA条形码的可行性.方法:利用ITS序列和18S序列对冬虫夏草和新疆虫草的DNA提取物进行PCR扩增并测序,并与GenBank数据库中下载的共23条近缘虫草的ITS序列和18S序列进行比对;利用MEGA 6.0分析软件计算的K-2-P距离,构建虫草样品和参比序列的18S、ITS序列的NJ树.结果:通过遗传距离和NJ树分析可知,本研究所用20份青海冬虫夏草和新疆虫草样本确定为虫草类,与其近缘虫草各自聚为一支;ITS序列构建的NJ树能够从种属水平上将青海冬虫夏草和新疆虫草成功鉴别开来.结论:ITS序列较18S序列更适合作为冬虫夏草和新疆虫草的条形码进行鉴定研究.

作者:马红梅;于静;戴明;张帆

来源:世界科学技术-中医药现代化 2016 年 18卷 5期

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作者:
马红梅;于静;戴明;张帆
来源:
世界科学技术-中医药现代化 2016 年 18卷 5期
标签:
冬虫夏草 新疆虫草 DNA条形码 ITS序列和18S序列 Cordyceps sinensis Cordyceps grsacilis DNA barcoding ITS and 18S sequences
目的:应用DNA条形码技术对青海冬虫夏草和新疆虫草进行鉴别,考查ITS序列和18S序列作为DNA条形码的可行性.方法:利用ITS序列和18S序列对冬虫夏草和新疆虫草的DNA提取物进行PCR扩增并测序,并与GenBank数据库中下载的共23条近缘虫草的ITS序列和18S序列进行比对;利用MEGA 6.0分析软件计算的K-2-P距离,构建虫草样品和参比序列的18S、ITS序列的NJ树.结果:通过遗传距离和NJ树分析可知,本研究所用20份青海冬虫夏草和新疆虫草样本确定为虫草类,与其近缘虫草各自聚为一支;ITS序列构建的NJ树能够从种属水平上将青海冬虫夏草和新疆虫草成功鉴别开来.结论:ITS序列较18S序列更适合作为冬虫夏草和新疆虫草的条形码进行鉴定研究.