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目的 研究凉血通瘀方对高血压大鼠急性脑出血模型脑组织miRNA表达的影响,对差异表达的miRNA靶基因进行分析,探索凉血通瘀方可能的药效机制.方法 将自发性高血压大鼠随机分成对照组(B)和实验组(C).适应性饲养一周后,C组灌胃凉血通瘀方,B组灌胃等体积生理盐水,连续5天,每天1次.构建脑出血模型后收集脑组织,借助全转录组测序技术获得miRNA表达量,与miRBase数据库比对获取已知miRNA,使用miRDeep2预测新miRNA.差异分析软件为DESeq2,筛选阈值为|log2FC|>=1并且P<0.05.对显著差异表达的miRNA进行靶基因预测,对靶基因进行GO功能、KEGG通路富集和PPI网络分析.结果 实验组和对照组对比,共发现21个显著差异表达的miRNA,上调有9个,下调有12个,共预测得到1243个有统计学意义的靶基因.GO富集分析发现,生物过程中突触囊泡分泌的调节、神经递质分泌的调节和神经递质运输的调节占前三位,神经元投射终点、全膜、质膜区域和细胞投射则是主要的细胞成分.分子功能分别为小GTPase绑定、底物特异性跨膜转运蛋白活性和离子跨膜转运体活性.通路分析结果显示,靶基因在癌证通路、pI3K-Akt信号通路、人类乳头瘤病毒感染、神经活性配体-受体相互作用和MAPK通路等分布广泛.采用STRING网站和Cytoscape软件,根据MCC算法筛选出ADRA2C、CASR

作者:李薇懿;李国春;魏乐心;钱勤;郭晴晴;杨诗锦;杨晓娟;王鹏程;陈杨

来源:世界科学技术-中医药现代化 2022 年 24卷 5期

知识库介绍

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作者:
李薇懿;李国春;魏乐心;钱勤;郭晴晴;杨诗锦;杨晓娟;王鹏程;陈杨
来源:
世界科学技术-中医药现代化 2022 年 24卷 5期
标签:
凉血通瘀方 miRNA 高通量测序 大鼠脑组织 差异表达 急性脑出血
目的 研究凉血通瘀方对高血压大鼠急性脑出血模型脑组织miRNA表达的影响,对差异表达的miRNA靶基因进行分析,探索凉血通瘀方可能的药效机制.方法 将自发性高血压大鼠随机分成对照组(B)和实验组(C).适应性饲养一周后,C组灌胃凉血通瘀方,B组灌胃等体积生理盐水,连续5天,每天1次.构建脑出血模型后收集脑组织,借助全转录组测序技术获得miRNA表达量,与miRBase数据库比对获取已知miRNA,使用miRDeep2预测新miRNA.差异分析软件为DESeq2,筛选阈值为|log2FC|>=1并且P<0.05.对显著差异表达的miRNA进行靶基因预测,对靶基因进行GO功能、KEGG通路富集和PPI网络分析.结果 实验组和对照组对比,共发现21个显著差异表达的miRNA,上调有9个,下调有12个,共预测得到1243个有统计学意义的靶基因.GO富集分析发现,生物过程中突触囊泡分泌的调节、神经递质分泌的调节和神经递质运输的调节占前三位,神经元投射终点、全膜、质膜区域和细胞投射则是主要的细胞成分.分子功能分别为小GTPase绑定、底物特异性跨膜转运蛋白活性和离子跨膜转运体活性.通路分析结果显示,靶基因在癌证通路、pI3K-Akt信号通路、人类乳头瘤病毒感染、神经活性配体-受体相互作用和MAPK通路等分布广泛.采用STRING网站和Cytoscape软件,根据MCC算法筛选出ADRA2C、CASR