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目的:利用生物信息学技术探究桂枝茯苓丸治疗子宫肌瘤的分子机制.方法:通过基因表达综合(GE O)数据库检索子宫肌瘤相关芯片,利用R语言分析得到差异表达基因.借助疾病数据库对子宫肌瘤已知靶基因进行检索.运用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选桂枝茯苓丸的主要有效成分及作用靶基因,3组靶基因映射出关键靶点,通过基因功能注释数据库(DAVID)对关键靶基因进行基因本体(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析.结果:筛选到桂枝茯苓丸有效成分11个,对应靶点121个;GEO数据库获得差异表达基因187个,检索到子宫肌瘤相关靶标271个;3组靶标最终获得映射靶基因20个,关键靶基因9个.桂枝茯苓丸主要通过ESR1、EGFR、SRC等核心靶基因调控类固醇结合、锌离子结合等生物过程及雌激素通路、催乳素通路、GnRH通路等多个信号通路干预子宫肌瘤发生发展过程.结论:应用生物信息学具有较高的置信度和参考价值,提供了桂枝茯苓丸治疗子宫肌瘤的新方向与新思路.

作者:刘一宁;纪江海

来源:世界中医药 2021 年 16卷 21期

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作者:
刘一宁;纪江海
来源:
世界中医药 2021 年 16卷 21期
标签:
生物信息学;中药;桂枝茯苓丸;子宫肌瘤;差异基因;生物过程;信号通路;分子机制
目的:利用生物信息学技术探究桂枝茯苓丸治疗子宫肌瘤的分子机制.方法:通过基因表达综合(GE O)数据库检索子宫肌瘤相关芯片,利用R语言分析得到差异表达基因.借助疾病数据库对子宫肌瘤已知靶基因进行检索.运用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选桂枝茯苓丸的主要有效成分及作用靶基因,3组靶基因映射出关键靶点,通过基因功能注释数据库(DAVID)对关键靶基因进行基因本体(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析.结果:筛选到桂枝茯苓丸有效成分11个,对应靶点121个;GEO数据库获得差异表达基因187个,检索到子宫肌瘤相关靶标271个;3组靶标最终获得映射靶基因20个,关键靶基因9个.桂枝茯苓丸主要通过ESR1、EGFR、SRC等核心靶基因调控类固醇结合、锌离子结合等生物过程及雌激素通路、催乳素通路、GnRH通路等多个信号通路干预子宫肌瘤发生发展过程.结论:应用生物信息学具有较高的置信度和参考价值,提供了桂枝茯苓丸治疗子宫肌瘤的新方向与新思路.