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研究旨在探讨生长激素释放激素基因(Growth hormone-releasing hormone,GHRH)对斑点叉尾(鲴)(Ictalurus punctatus)生长性状的影响.采用DNA混池测序法筛选GHRH基因的单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点,使用SNaPshot法将筛选到的SNPs多态性位点进行分型,并对这些位点进行连锁不平衡和单倍型分析.结果表明,在GHR基因内含子区域共检测到4个SNPs位点,并成功地对3个位点进行了分型,3个位点间均不存在强连锁不平衡;3个SNPs位点在176尾斑点叉尾(鲴)中形成了6种有效单倍型.关联分析表明SNP位点g.6301 G>A的AA基因型的体质量显著性地高于AG和GG型(P<0.05),比群体的平均体质量高14%.单倍型组合H1/H4和H1/H5个体的体质量和体长极显著性地高于其他单倍型组合(P<0.01),体质量比群体平均体质量分别高30%和15%,体长比群体平均体长分别高7%和6%.研究为斑点叉尾(鲴)生长性状分子标记辅助选育和QTL定位提供了参考依据.

作者:张世勇;钟立强;秦钦;王明华;潘建林;陈校辉;边文冀

来源:水生生物学报 2016 年 40卷 5期

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作者:
张世勇;钟立强;秦钦;王明华;潘建林;陈校辉;边文冀
来源:
水生生物学报 2016 年 40卷 5期
标签:
斑点叉尾(鲴) GHRH SNP SNaPshot 生长性状 单倍型分析 关联分析 Ictalures punctatus GHRH SNP SNaPshot Growth traits Haplotype Association
研究旨在探讨生长激素释放激素基因(Growth hormone-releasing hormone,GHRH)对斑点叉尾(鲴)(Ictalurus punctatus)生长性状的影响.采用DNA混池测序法筛选GHRH基因的单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点,使用SNaPshot法将筛选到的SNPs多态性位点进行分型,并对这些位点进行连锁不平衡和单倍型分析.结果表明,在GHR基因内含子区域共检测到4个SNPs位点,并成功地对3个位点进行了分型,3个位点间均不存在强连锁不平衡;3个SNPs位点在176尾斑点叉尾(鲴)中形成了6种有效单倍型.关联分析表明SNP位点g.6301 G>A的AA基因型的体质量显著性地高于AG和GG型(P<0.05),比群体的平均体质量高14%.单倍型组合H1/H4和H1/H5个体的体质量和体长极显著性地高于其他单倍型组合(P<0.01),体质量比群体平均体质量分别高30%和15%,体长比群体平均体长分别高7%和6%.研究为斑点叉尾(鲴)生长性状分子标记辅助选育和QTL定位提供了参考依据.