研究以日本鳗鲡(Anguilla japonica Temminck et Schlegel)为研究对象,根据其基因组数据库,预测并扩增出2类,共5个溶菌酶基因,包括1个C-型溶菌酶和4个G-型溶菌酶,分别命名为AJLysC、AJLysG1、AJLysG2、AJLysG3和AJLysG4.它们的cDNA全长分别为811、749、1352、1175和733 bp,编码143、193、185、185和187个氨基酸.SignalP预测表明,AJLysC和AJLysG1的N-端分别包括15和19氨基酸的信号肽,另外3种溶菌酶没有信号肽.基因组分析显示,AJLysC、AJLysG2、AJLysG3和AJLysG4的基因结构与其他鱼类的同类溶菌酶的基因结构相似,C-型溶菌酶具有4个外显子,G-型则具有5个.但是,AJLysG1的基因结构与其他鱼类G-型溶菌酶不同,具有6个外显子,与其他鱼类溶菌酶的蛋白序列比较,发现AJLysG1缺失其他G-型溶菌酶存在的第2个酶活性位点氨基酸,即天冬氨酸Asp.AJLysC与其他很多物种的C-型溶菌酶具有较高的同一性,如与牙鲆的同一性为72.7
作者:杨勇;黄贝;黄文树;段明珠;张芳芳;聂品
来源:水生生物学报 2017 年 41卷 4期