磷脂酶A2在磷脂代谢、炎症反应、细胞增殖和动脉粥样硬化等生理病理过程中发挥作用.为了探究sPLA2-III在鲤(Cyprinus carpio Linnaeus)中的生物学功能,实验使用BLAST同源搜索和线性分析在鲤(Cyprinus carpio)基因组中挖掘得到5个sPLA2-III基因,分别位于5个连锁群,分别命名为Ccpla2g3a1、Ccpla2g3a2、Ccpla2g3b、Ccpla2g3c1和Ccpla2g3c2.基因结构和序列分析显示Ccpla2g3as含有7个外显子,Ccpla2g3b和Ccpla2g3cs则均含有4个外显子,分别编码530、525、461、752和753个氨基酸,均含有PLA2_bee_venom_like region和sPLA2-III特征序列.线性分析显示,Ccpla2g3a1和Ccpla2g3a2,Ccpla2g3c1和Ccpla2g3c2来自鲤特异的染色体加倍事件.从2R(Two rounds of genome duplication)鱼雀鳝(Lepisosteus oculatus)到3R(Fish-specific genome duplication,FSGD)鱼斑马鱼(Danio rerio)等,雀鳝的pla2g3a(b)加倍为3R鱼的pla2g3a和pla2g3b,pla2g3c因在3R鱼的一个连锁群上丢失,故3R鱼中只保留一个基因.同源性分析表明已有鱼类Pla2g3a、Pla2g3b和Pla2g3c垂直同源蛋白之间相似性分别为48.8%—93.2%、37.6%—74.3%和49.6%—97.6%,鲤和斑马鱼的垂直同源基因之间相似性最高.系统发育结果显示,鱼类及其祖先雀鳝的Pla2g3c以100%的置信
作者:许迪辉;李红霞;李建林;唐永凯;王钦;张磊;沈泽恩;俞菊华
来源:水生生物学报 2019 年 43卷 6期