以印度块菌-云南松菌根际土壤细菌为研究对象,研究其种群组成和结构特征.(1)稀释平板法分离得到印度块菌-云南松菌根际土壤细菌的纯培养菌株,对菌株的16S rRNA序列测序分析,对测序的菌株数量和得到的OTUs数量绘制物种累积曲线,当物种累积曲线趋于平缓时,对OTUs进行系统发育分析,揭示可培养细菌的种群组成和结构特征.(2)对印度块菌-云南松菌根际土壤细菌16S rRNA基因的V3-V4区进行高通量测序,分析全部细菌类群的种群组成和结构特征.(1)分离得到菌根际可培养细菌793株,分属于3个属的61个OTUs,其中假单胞菌属(Pseudomonas)序列占总序列的86%,不动杆菌属(Acinetobacter)序列占总序列的9.8%,链霉菌属(Streptomyces)序列占总序列的6.5%.假单胞菌是印度块菌-云南松菌根际土壤可培养细菌的绝对优势类群.(2)高通量测序得到菌根际细菌序列8937条,分属于20个门、198属、2073个OTUs.隶属于变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)和酸杆菌门(Acidobacteria)的OTUs占总OTUs的65.9%,变形菌门、放线菌门和酸杆菌门细菌是印度块菌-云南松菌根际土壤细菌的优势细菌.隶属于黄杆菌属(Flavobacterium)、根瘤菌属(Rhizobium)和假黄色单胞菌属(Pseudoxanthomona)的OTUs占总OTUs的33%,黄杆菌属、根瘤菌属和假黄
作者:邓晓娟;闫兴富;刘建利;刘培贵
来源:生态学报 2018 年 38卷 19期