两栖类正经历全球范围内的种群衰退,很多两栖动物集群灭绝事件与环境病原体(如壶菌(Batrachochytrium dendrobatidis)的侵扰有关.MHC基因的表达产物在有颌脊椎动物免疫应答过程中起关键作用,其多态性通常与动物对疾病的抗性或易感性密切相关,因而被认为是研究动物适应性进化的最佳候选基因之一.本文对中国特有的无尾两柄动物凹耳蛙(Odorrana tormota)MHC Ⅱ类B基因多态性进行初步研究.首先,利用l对通用引物扩增出凹耳蛙MHC Ⅱ类B基因exon2长约180 bp的DNA片段.在此基础上,利用ligation-mediated PCR进一步获取侧翼未知序列,序列拼接后长2,030 bp,包含exon2以及intronl和intron2的部分序列.基于上述序列设计出凹耳蛙B基因exon2特异性引物(IIQ1BU/IIQ1BD),对该物种黄山种群32个样品进行PCR扩增和克隆测序,共获得34个不同的等位基因,等位基因序列核苷酸和氨基酸变异位点的比例分别为16.17%(33/204)和26.87%(18/67),大多数氨基酸变异位点位于推测的抗原结合位点(antigen binding sites,ABS).每个样品包含2-5个等位基因,结合等位基因序列特征以及cDNA表达分析结果,推测凹耳蛙至少拥有3个可表达的B基因座位.与文献报道的蛙科其他物种比较后发现,尽管凹耳蛙目前的分布区非常狭窄,但其MHC Ⅱ类B基因多态性明显
作者:李方;疏义林;吴海龙
来源:生物多样性 2012 年 20卷 2期