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由于受到气候变化、土地利用变化及环境污染等诸多因素的干扰,真菌多样性受到不容忽视的威胁,亟需得到保护.构建物种数据库是实现真菌多样性研究和保护的重要前提.近年来兴起的DNA条形码及metabarcoding 技术能够在很大程度上弥补传统鉴定方法的缺陷,可对真菌物种进行大规模、准确、快速、高效地鉴定.本文梳理了metabarcoding技术在真菌物种多样性评估、真菌多样性影响机制和真菌古生态重建等研究中的应用,同时强调了metabarcoding技术用于真菌多样性研究尚处于初期阶段,在构建有效参照数据库、优化实验流程以及升级生物信息学工具等方面仍需要进一步的完善.建议加强真菌分类学家、生态学家以及计算机工具研发工程师之间的合作,共同解决metabarcoding技术在真菌多样性研究及应用中面临的问题,为宏观尺度上真菌多样性保护提供更加科学的依据.

作者:曹云;沈文静;陈炼;胡飞龙;周蕾;徐海根

来源:生物多样性 2016 年 24卷 8期

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曹云;沈文静;陈炼;胡飞龙;周蕾;徐海根
来源:
生物多样性 2016 年 24卷 8期
标签:
metabarcoding DNA条形码 真菌多样性保护 物种鉴定 高通量测序 metabarcoding DNA barcoding fungal diversity conservation species identification high-throughput sequencing
由于受到气候变化、土地利用变化及环境污染等诸多因素的干扰,真菌多样性受到不容忽视的威胁,亟需得到保护.构建物种数据库是实现真菌多样性研究和保护的重要前提.近年来兴起的DNA条形码及metabarcoding 技术能够在很大程度上弥补传统鉴定方法的缺陷,可对真菌物种进行大规模、准确、快速、高效地鉴定.本文梳理了metabarcoding技术在真菌物种多样性评估、真菌多样性影响机制和真菌古生态重建等研究中的应用,同时强调了metabarcoding技术用于真菌多样性研究尚处于初期阶段,在构建有效参照数据库、优化实验流程以及升级生物信息学工具等方面仍需要进一步的完善.建议加强真菌分类学家、生态学家以及计算机工具研发工程师之间的合作,共同解决metabarcoding技术在真菌多样性研究及应用中面临的问题,为宏观尺度上真菌多样性保护提供更加科学的依据.