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胰岛素样生长因子受体Ⅰ的3'UTR长度大于7 kb,结构复杂,有多种miRNAs的结合位点,参与信号通路中MAPK及PI3K/AKT的调节和多种肿瘤的形成和发展,通过生物信息学分析知道其结构特点,为后续研究提供思路.分析表明儿童神经胶质瘤中IGF1R的3'UTR与miRNAs结合位点突变率最高.分析IGF1R序列3'UTR的结构,miRNAs结合位点,氨基酸序列的理化性质,亲疏水性,糖基化和磷酸化位点,二级结构和三级结构建模.IGF1R三级结构与配体IGF1的三级结构模拟分子对接,得到2种蛋白相互作用的氨基酸位置及名称.因此,通过对IGF1R 3'UTR突变,降低与miRNAs的结合,IGF1R表达上调,同时改变与IGF1的氨基酸结合位点,降低2种蛋白的相互作用,从而抑制IGF1R的作用.

作者:麦秀英;李萍;徐柳

来源:生物工程学报 2016 年 32卷 5期

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作者:
麦秀英;李萍;徐柳
来源:
生物工程学报 2016 年 32卷 5期
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胰岛素样生长因子受体Ⅰ 序列分析 三维建模 分子对接 insulin-like growth factor-Ⅰ receptor (IGF1R) sequence analysis 3D-struture modeling molecular docking
胰岛素样生长因子受体Ⅰ的3'UTR长度大于7 kb,结构复杂,有多种miRNAs的结合位点,参与信号通路中MAPK及PI3K/AKT的调节和多种肿瘤的形成和发展,通过生物信息学分析知道其结构特点,为后续研究提供思路.分析表明儿童神经胶质瘤中IGF1R的3'UTR与miRNAs结合位点突变率最高.分析IGF1R序列3'UTR的结构,miRNAs结合位点,氨基酸序列的理化性质,亲疏水性,糖基化和磷酸化位点,二级结构和三级结构建模.IGF1R三级结构与配体IGF1的三级结构模拟分子对接,得到2种蛋白相互作用的氨基酸位置及名称.因此,通过对IGF1R 3'UTR突变,降低与miRNAs的结合,IGF1R表达上调,同时改变与IGF1的氨基酸结合位点,降低2种蛋白的相互作用,从而抑制IGF1R的作用.