肠道菌群与人体健康的关系密切,通过检测肠道菌群可以获得有关健康的信息.新鲜粪便不易获得,很难做到快速低温冷冻,在进行标准化和大规模人群采样时,可用于常温条件下采集和保存样本的保存液可以弥补采集样本数量多、地域分布广、现场采样条件多样、工作量大、运输条件差等条件不足.本研究招募了5名健康志愿者,采集他们的粪便样本后,通过对比不同市售微生物样本采集常温保存液对新鲜粪便样本的影响,评估了各类保存液的保存效果.在室温下把粪便放置于5种保存液,在第0、1、3、7、15、30天提取元基因组DNA,进行16SrRNAV3-V4区高通量测序,来分析不同保存液,在不同时间段对肠道菌群组成的影响.结果显示,不同保存液对肠道菌群的影响存在差异,与对照组相比,不同保存液对样本中的OUT数量影响不大;保存液A、B和C在菌群构成上更接近对照组,保存液D会明显改变肠道菌群组成,使放线菌门(Actinobacteria)和厚壁菌门(Firmicutes)增加;随着时间延长,各类保存液都有降低菌群多样性趋势,保存液E降低菌群多样性更明显;第30天时,5种保存液都会改变肠道菌群构成;肠道菌群组成存在个体差异,是影响各样本相似性的主要因素,来自不同志愿者的粪便样本,无论何种保存液和保存时间,彼此之间更接近.不同保存液对革兰氏阳性杆菌、革兰氏
作者：段云峰；律娜；蔡峰；朱宝利
来源：生物工程学报 2020 年 36卷 12期
