为了探讨铁死亡相关长链非编码RNA(long non-coding RNAs,lncRNA)在预测肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)患者临床预后方面的价值,基于铁死亡相关lncRNA构建了预后风险模型,用于评估HCC患者的生存及预后状况.从癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库中收集HCC患者的转录组及临床数据,通过R软件包"LIMMA"鉴定出HCC与正常组织之间差异表达的lncRNA和mRNA,从FerrDB数据库中收集铁死亡相关mRNA.将上述mRNA取交集后得到差异表达的铁死亡相关mRNA,通过GO和KEGG分析阐明这些差异表达的mRNA在HCC中的作用.通过Pearson相关性分析得到了与铁死亡相关mRNA具有显著相关性的差异lncRNA.将这些lncRNA纳入Cox回归分析构建铁死亡相关lncRNA的预后风险模型.运用Kaplan-Meier(KM)生存分析、决策曲线分析(decision curve analysis,DCA)、受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线分析及独立预后分析评估该预后风险模型的准确性.研究共鉴定出17 个 铁 死 亡 相 关 lncRNA(ZFPM2-AS1、AC012073.1、AL031985.3、AC026401.3、POLH-AS1、SNHG21、LINC00205、LINC00942、AP001469.3、AL139384.1、AC145207.8、AC090772.3、AL603839.3、SNHG10、AC099850.1、MKLN1-AS 和AL928654.1),它们是H

作者：王彦容；郭元彪

来源：生物技术进展 2023 年 13卷 3期