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根据 GenBank 中海州香薷(Elsholtzia haichowensis)液泡转化酶基因 EhNvINV(JX500755)和 EhCvINV(JX500756)的序列设计特异性引物,克隆 cDNA 全长序列,并通过生物信息学分析基因及推导的蛋白序列,利用 SWISS-MODEL 进行同源建模,并与蔗糖分子进行模拟对接,实时荧光定量 PCR 分析 EhNvINV 和 EhCvINV 在铜胁迫下的转录表达。结果表明,海州香薷非抗性和抗性种群液泡转化酶蛋白 EhNvINV 和 EhCvINV 在114和346处存在氨基酸趋异位点,模拟3D 结构相似,仅在趋异位点 Glu114/Gln114和 Leu346/Pro346处有差别。EhNvINV、EhCvINV 和模拟突变体(EhNvINV-E114Q 和 EhNvINV-L346P)与蔗糖分子对接形成的活性中心构象基本一致,但在空间位置上存在细微差异。实时荧光定量 PCR 结果表明铜胁迫7 d 后,EhCvINV 的表达受铜的诱导,而 EhNvINV 受铜的抑制。

作者:蔡深文;徐仲瑞;熊治廷;王加真;陈瑶

来源:生物技术通报 2016 年 32卷 10期

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蔡深文;徐仲瑞;熊治廷;王加真;陈瑶
来源:
生物技术通报 2016 年 32卷 10期
标签:
海州香薷 液泡转化酶 铜胁迫 转录表达 Elsholtzia haichowensis vacuolar invertase copper stress transcript expression
根据 GenBank 中海州香薷(Elsholtzia haichowensis)液泡转化酶基因 EhNvINV(JX500755)和 EhCvINV(JX500756)的序列设计特异性引物,克隆 cDNA 全长序列,并通过生物信息学分析基因及推导的蛋白序列,利用 SWISS-MODEL 进行同源建模,并与蔗糖分子进行模拟对接,实时荧光定量 PCR 分析 EhNvINV 和 EhCvINV 在铜胁迫下的转录表达。结果表明,海州香薷非抗性和抗性种群液泡转化酶蛋白 EhNvINV 和 EhCvINV 在114和346处存在氨基酸趋异位点,模拟3D 结构相似,仅在趋异位点 Glu114/Gln114和 Leu346/Pro346处有差别。EhNvINV、EhCvINV 和模拟突变体(EhNvINV-E114Q 和 EhNvINV-L346P)与蔗糖分子对接形成的活性中心构象基本一致,但在空间位置上存在细微差异。实时荧光定量 PCR 结果表明铜胁迫7 d 后,EhCvINV 的表达受铜的诱导,而 EhNvINV 受铜的抑制。