运用基因芯片技术获取以稳定转染HBx基目的肝癌细胞HepG2(HepG2 -X)及非转染的肝癌细胞HepG2中差异表达的基因,并对其中一条基因进行的生物信息学分析.采用人肝癌G2细胞( HepG2)细胞系为对照组,以稳定转染HBx的HepG2细胞为实验组,抽取总RNA,经过反转录cDNA,对照组用Cy3实验组用Cy5荧光标记,获得cDNA探针；经杂交、洗涤后,通过ImaGene3.0软件进行分析统计.通过基因芯片筛选,获得643条与乙肝相关性肝细胞性癌相关的基因,其中FOLR1基因差异性表达最显著,HBx显著下调其表达,同源性比较分析结果表明,其碱基序列与已经报道的其他12种哺乳动物的相似率为67％ -99％,且符合种属之间的进化关系.基因芯片筛选HBx诱导的HepG2差异表达基因具有样品用量少,高质量,高速度,高敏感等特性.FOLR1可能为HBV相关肝癌的发生、转移的诊断、靶基因治疗和预后评估提供一定的依据.
作者：姚杨；苏杰；刘凯歌；许刚柱；除锐
来源：生物信息学 2012 年 10卷 2期
