用生物信息学的方法分析不同物种的α-葡糖糖苷酶的亲缘关系,分析降血糖药物米格列醇与甜菜( Beta vulgaris)的α-葡糖糖苷酶相互作用位点在其他亲缘关系较近的物种中相应的氨基酸变化特点,结果表明米格列醇位于一个凹向酶分子内部的狭窄的结合口袋中,其间的相互作用主要以静电相互作用、氢键和范德华力为主. 由于米格列醇的强水溶性和多羟基的特点,与酸性的天冬氨酸之间形成多个O-H氢键,对甜菜( Beta vulgaris)的α-葡萄糖苷酶具有较好的抑制作用. 通过TM-HMM预测甜菜( Beta vulgaris)的α-葡萄糖苷酶的序列,结果未发现跨膜区. 通过多序列比对发现,在米格列醇与甜菜( Beta vulgaris)的α-葡萄糖苷酶相互作用位点处的氨基酸中,在与其亲缘关系较近的5个物种茶( Camellia sinensis) ,黄瓜( Cucumis sativus),木本棉(Gossypium arboretum),甘庶属割手密(Spontaneum)和蒺藜状苜蓿(Medicago truncatula)中有81.82
作者：齐燕姣；陆会宁；金能智；赵娅敏
来源：生物信息学 2015 年 13卷 3期
