通过比较登革热患者和健康人群转录组数据,识别差异基因,构建失调ceRNA网络,筛选关键基因富集分析,解析潜在生物学功能,助力登革热诊断标志物的研究.从GEO数据库下载登革热外周血芯片数据,识别差异基因并进行富集分析.结合miRNA-mRNA互作数据,利用超几何算法和皮尔森相关性计算方法识别登革热失调ceRNA互作对,使用Cytoscape软件可视化ceRNA网络与模块挖掘,对网络模块进行功能富集及外部数据验证表达模式.筛选出 251 个差异基因,发现其富集在细胞周期等生物学通路中.经外部数据验证,网络模块基因的表达趋势与训练集数据大致相同,表明模块基因在登革热疾病中的潜在诊断效能.本研究可为确定有效的疾病诊断分子标志物提供思路.
作者：郑德华；许达华；毕小慢；曹勐；徐智洲；陈荔旸；李思；鲁健平；李孔宁
来源：生物信息学 2023 年 21卷 4期
