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目的 分析儿童恶性疟疾患者外周血基因表达谱、关键蛋白的改变及其生理学功能,为疟疾防治提供新依据.方法 从基因芯片公共数据库GEO中获得疟疾惠儿外周血基因芯片数据,共5例疟疾患儿,均依据WHO疟疾诊断标准明确诊断,采用自体匹配设计,每位患儿分别在轻症、重症疟疾时采集外周血;分析不同病情患儿的基因表达谱、蛋白相互作用网络、分子生物学过程、基因功能,寻找疟疾惠儿病情进展相关的关键基因.结果 623个(1.93%)差异表达基因可鉴别区分轻症、重症患儿;OAS2,OAS3,IFIT3和USP18基因是差异基因蛋白-蛋白交互作用网络(protein-protein interac-tions,PPI)中子网络的核心节点;差异表达基因主要参与机体的免疫防御、免疫应答、对外部刺激应答、干扰素-1型通路的活化等生物学功能.结论 疟疾患儿病情的进展可能受OAS2,OAS3,IFIT3和USP18等基因的调控,儿童的免疫防御能力下降与病情进展具有重要的关系.

作者:杨维;彭晶;何秋仙;张荣强

来源:现代检验医学杂志 2017 年 32卷 4期

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作者:
杨维;彭晶;何秋仙;张荣强
来源:
现代检验医学杂志 2017 年 32卷 4期
标签:
疟原虫 疟疾 差异表达基因 生物信息学 plasmodium malaria differentially expressed genes bioinformatics
目的 分析儿童恶性疟疾患者外周血基因表达谱、关键蛋白的改变及其生理学功能,为疟疾防治提供新依据.方法 从基因芯片公共数据库GEO中获得疟疾惠儿外周血基因芯片数据,共5例疟疾患儿,均依据WHO疟疾诊断标准明确诊断,采用自体匹配设计,每位患儿分别在轻症、重症疟疾时采集外周血;分析不同病情患儿的基因表达谱、蛋白相互作用网络、分子生物学过程、基因功能,寻找疟疾惠儿病情进展相关的关键基因.结果 623个(1.93%)差异表达基因可鉴别区分轻症、重症患儿;OAS2,OAS3,IFIT3和USP18基因是差异基因蛋白-蛋白交互作用网络(protein-protein interac-tions,PPI)中子网络的核心节点;差异表达基因主要参与机体的免疫防御、免疫应答、对外部刺激应答、干扰素-1型通路的活化等生物学功能.结论 疟疾患儿病情的进展可能受OAS2,OAS3,IFIT3和USP18等基因的调控,儿童的免疫防御能力下降与病情进展具有重要的关系.