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目的 基于液相芯片技术建立一种可同时快速检测6种临床常见血流感染厌氧菌的方法.方法 通过GenBank寻找脆弱拟杆菌、厌氧消化链球菌、具核梭杆菌、中间普雷沃菌、产气荚膜梭菌和痤疮丙酸杆菌的16S rDNA基因序列,经序列比对分析,选择菌内保守菌间特异的区域作靶序列,使用Primer 5.0软件设计特异性引物及探针,建立不对称多重PCR扩增体系,将PCR产物与偶联核酸探针的荧光微球混合物进行杂交,建立一种多重检测方法,并对该方法的特异度、灵敏度和重复性进行评价.收集2020年6月~2022年5月东莞市厚街医院阳性血厌氧培养瓶84例及阴性培养瓶16例,应用建立的方法进行检测,结果与传统培养法进行比较.结果 6种厌氧菌靶基因序列经PCR扩增后,电泳成像清晰可见6条目标条带;经反应体系优化,生物素标记与非标记引物浓度比为4:1时,选择退火温度56℃进行多重扩增,加入5μl PCR产物,52℃温育20 min检测效果最佳;各目标序列荧光强度中位值(median fluorescence intensity,MFI)>1000,无非特异性信号;最低检测限可达103cfu/ml~104cfu/ml;当菌液浓度为105cfu/ml时,批内及批间的变异系数分别在7.38%和11.10%以下;100例临床样本中6种厌氧菌的检测结果与培养法一致.结论 成功建立一种快速、简便、高效的液相芯片方法,可同时检测6

作者:陈梅莲;曾见芬;张欣选;周文娟;余洁玲;彭兰芬;付文金

来源:现代检验医学杂志 2023 年 38卷 2期

知识库介绍

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作者:
陈梅莲;曾见芬;张欣选;周文娟;余洁玲;彭兰芬;付文金
来源:
现代检验医学杂志 2023 年 38卷 2期
标签:
厌氧菌 液相芯片 多重聚合酶链式反应
目的 基于液相芯片技术建立一种可同时快速检测6种临床常见血流感染厌氧菌的方法.方法 通过GenBank寻找脆弱拟杆菌、厌氧消化链球菌、具核梭杆菌、中间普雷沃菌、产气荚膜梭菌和痤疮丙酸杆菌的16S rDNA基因序列,经序列比对分析,选择菌内保守菌间特异的区域作靶序列,使用Primer 5.0软件设计特异性引物及探针,建立不对称多重PCR扩增体系,将PCR产物与偶联核酸探针的荧光微球混合物进行杂交,建立一种多重检测方法,并对该方法的特异度、灵敏度和重复性进行评价.收集2020年6月~2022年5月东莞市厚街医院阳性血厌氧培养瓶84例及阴性培养瓶16例,应用建立的方法进行检测,结果与传统培养法进行比较.结果 6种厌氧菌靶基因序列经PCR扩增后,电泳成像清晰可见6条目标条带;经反应体系优化,生物素标记与非标记引物浓度比为4:1时,选择退火温度56℃进行多重扩增,加入5μl PCR产物,52℃温育20 min检测效果最佳;各目标序列荧光强度中位值(median fluorescence intensity,MFI)>1000,无非特异性信号;最低检测限可达103cfu/ml~104cfu/ml;当菌液浓度为105cfu/ml时,批内及批间的变异系数分别在7.38%和11.10%以下;100例临床样本中6种厌氧菌的检测结果与培养法一致.结论 成功建立一种快速、简便、高效的液相芯片方法,可同时检测6