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目的:筛选和分析胃癌和正常胃组织间DNA甲基化差异片段.方法:通过甲基化敏感性代表性差异分析法(methylation-sensitive-representational difference analysis,MS-RDA),筛选胃癌和正常胃组织间DNA甲基化差异片段,经克隆、测序后进行生物信息学分析.结果:获得3个甲基化差异片段CRS1308、CRS1309、CRS1310序列.其中CRS1309和CRS1310已被GenBank收录,登陆号分别为AY887106和AY887107.CRS1309序列与LOC440683基因、LOC440887基因的3端、DRD5基因均有很高的相似性;CRS1310序列与1999年Minoru Toyota在人类结肠癌中分离出的核糖体RNA上的甲基化差异性CpG岛有很高的相似性.结论:胃癌和正常胃组织间DNA甲基化存在差异,LOC440683、LOC440887、DRD5基因的异常甲基化可能与胃癌的发生相关,胃癌中CRS1310序列所在核糖体RNA上的CpG岛易发生甲基化.

作者:王珣;廖爱军;苏琦

来源:现代肿瘤医学 2006 年 14卷 5期

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作者:
王珣;廖爱军;苏琦
来源:
现代肿瘤医学 2006 年 14卷 5期
标签:
胃癌 DNA甲基化 差异片段
目的:筛选和分析胃癌和正常胃组织间DNA甲基化差异片段.方法:通过甲基化敏感性代表性差异分析法(methylation-sensitive-representational difference analysis,MS-RDA),筛选胃癌和正常胃组织间DNA甲基化差异片段,经克隆、测序后进行生物信息学分析.结果:获得3个甲基化差异片段CRS1308、CRS1309、CRS1310序列.其中CRS1309和CRS1310已被GenBank收录,登陆号分别为AY887106和AY887107.CRS1309序列与LOC440683基因、LOC440887基因的3端、DRD5基因均有很高的相似性;CRS1310序列与1999年Minoru Toyota在人类结肠癌中分离出的核糖体RNA上的甲基化差异性CpG岛有很高的相似性.结论:胃癌和正常胃组织间DNA甲基化存在差异,LOC440683、LOC440887、DRD5基因的异常甲基化可能与胃癌的发生相关,胃癌中CRS1310序列所在核糖体RNA上的CpG岛易发生甲基化.