目的:探讨及分析EGFR突变肺癌中差异表达长链非编码RNA的表达谱及分析其功能.方法:从NCBI公共数据平台GEO下载肺癌基因芯片数据GSE31210,获得127例EGFR突变肺癌和20例正常组织的基因表达谱数据,R软件包处理获得差异表达的lncRNA.并用荧光定量PCR法检测19对EGFR突变肺癌患者和癌旁标本,验证候选基因lncRNA CR749465的差异表达.利用DAVID分析候选lncRNA相关靶基因的GO分类及pathway通路.结果:GSE31210芯片数据分析显示,127个基因在EGFR突变肺癌组织出现差异表达,其中上调的有96个,下调的有31个.经荧光定量 PCR验证,候选基因lncRNA CR749465基因表达情况与芯片数据分析结果一致.结论:EGFR突变肺癌中存在明显的lncRNAs差异性表达,通过GO及KEGG分析发现,CR749465可能在EGFR突变肺癌的发生和发展中发挥重要作用.
作者:张晓燕;阎超;徐萍;何信佳
来源:现代肿瘤医学 2017 年 25卷 10期