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目的:探讨PTGER3在肠型胃癌中的表达及临床意义.方法:从GEO数据库的GSE29272数据集中下载58对肠型胃癌组织和癌旁组织的基因表达谱数据,筛选出差异表达基因,并利用DAVID数据库进行基因的功能富集分析.采用WGCNA软件对差异表达基因进行权重基因共表达网络分析,以挖掘出肠型胃癌发生发展过程中的关键调控基因.分析关键调控基因表达水平与肠型胃癌预后的相关性,并在Kaplan-Meier Plotter数据库中验证其预后意义.结果:共获得393个差异表达基因,DAVID功能富集分析显示它们主要涉及ECM受体相互作用、p53信号通路、PI3K-Akt信号通路和癌症信号通路等.PTGER3是癌症信号通路上的一个重要成员,在肠型胃癌组织中的表达明显上调.差异基因的共表达网络分析发现PTGER3是模块枢纽基因,与胃癌的发生发展关系密切.GSE29272数据集和Kaplan-Meier Plotter数据库的生存分析均显示PT-GER3高表达与预后不良显著相关(P=0.034;P<0.001).结论:PTGER3表达上调可能参与了肠型胃癌的发生发展,而且其高表达提示患者预后不良.

作者:张昱;陈颖;徐红

来源:现代肿瘤医学 2018 年 26卷 11期

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作者:
张昱;陈颖;徐红
来源:
现代肿瘤医学 2018 年 26卷 11期
标签:
肠型胃癌 PTGER3 肿瘤数据库 生物信息学 预后 intestinal gastric cancer PTGER3 tumor database bioinformatics prognosis
目的:探讨PTGER3在肠型胃癌中的表达及临床意义.方法:从GEO数据库的GSE29272数据集中下载58对肠型胃癌组织和癌旁组织的基因表达谱数据,筛选出差异表达基因,并利用DAVID数据库进行基因的功能富集分析.采用WGCNA软件对差异表达基因进行权重基因共表达网络分析,以挖掘出肠型胃癌发生发展过程中的关键调控基因.分析关键调控基因表达水平与肠型胃癌预后的相关性,并在Kaplan-Meier Plotter数据库中验证其预后意义.结果:共获得393个差异表达基因,DAVID功能富集分析显示它们主要涉及ECM受体相互作用、p53信号通路、PI3K-Akt信号通路和癌症信号通路等.PTGER3是癌症信号通路上的一个重要成员,在肠型胃癌组织中的表达明显上调.差异基因的共表达网络分析发现PTGER3是模块枢纽基因,与胃癌的发生发展关系密切.GSE29272数据集和Kaplan-Meier Plotter数据库的生存分析均显示PT-GER3高表达与预后不良显著相关(P=0.034;P<0.001).结论:PTGER3表达上调可能参与了肠型胃癌的发生发展,而且其高表达提示患者预后不良.