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目的:利用整合生物信息学手段分析EZH2(enhancer of zeste 2 polycomb repressive complex 2 subunit)基因在乳腺癌中的表达及其临床意义.方法:在肿瘤基因组计划数据库(The Cancer Genome Atlas,TCGA)中下载乳腺癌与正常乳腺组织的基因表达谱数据,进一步利用Ualcan数据库和人类蛋白质图谱(The Human Protein Atlas)数据库数据分析EZH2基因在乳腺癌中的mRNA及蛋白表达水平.利用Ualcan数据库分析EZH2基因的甲基化水平并筛选其共表达基因;对EZH2及其共表达基因进行GO(Gene Ontology)富集分析和KEGG通路分析以明确EZH2的共表达基因参与的生物学过程和相关通路;使用Kaplan-Meier生存分析法分析乳腺癌患者的总生存期、无病生存期、无远处转移生存期及后进展生存期与EZH2基因表达水平的关系并绘制生存曲线.结果:与正常乳腺组织相比,EZH2在乳腺癌组织中的mRNA及蛋白表达量明显升高.而EZH2的甲基化程度在乳腺癌组织与正常乳腺组织中则差异不明显.同时,EZH2的表达水平与年龄、乳腺癌分期及乳腺癌分子分型等因素密切相关.EZH2及其共表达基因主要参与了核碱基的调节、细胞周期调控、染色体分离、DNA复制、DNA修复等生物学过程,并参与了细胞周期、DNA复制、M/G1期转化、M期、有丝分裂前中期、ATM通路等生物学通路.此外

作者:赵昕辉;杨万里;张浩萌;武赫;韩晓刚;孟庆杰;吕勇刚

来源:现代肿瘤医学 2020 年 28卷 23期

知识库介绍

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作者:
赵昕辉;杨万里;张浩萌;武赫;韩晓刚;孟庆杰;吕勇刚
来源:
现代肿瘤医学 2020 年 28卷 23期
标签:
乳腺癌 EZH2 TCGA 生物标志物 生物信息学分析
目的:利用整合生物信息学手段分析EZH2(enhancer of zeste 2 polycomb repressive complex 2 subunit)基因在乳腺癌中的表达及其临床意义.方法:在肿瘤基因组计划数据库(The Cancer Genome Atlas,TCGA)中下载乳腺癌与正常乳腺组织的基因表达谱数据,进一步利用Ualcan数据库和人类蛋白质图谱(The Human Protein Atlas)数据库数据分析EZH2基因在乳腺癌中的mRNA及蛋白表达水平.利用Ualcan数据库分析EZH2基因的甲基化水平并筛选其共表达基因;对EZH2及其共表达基因进行GO(Gene Ontology)富集分析和KEGG通路分析以明确EZH2的共表达基因参与的生物学过程和相关通路;使用Kaplan-Meier生存分析法分析乳腺癌患者的总生存期、无病生存期、无远处转移生存期及后进展生存期与EZH2基因表达水平的关系并绘制生存曲线.结果:与正常乳腺组织相比,EZH2在乳腺癌组织中的mRNA及蛋白表达量明显升高.而EZH2的甲基化程度在乳腺癌组织与正常乳腺组织中则差异不明显.同时,EZH2的表达水平与年龄、乳腺癌分期及乳腺癌分子分型等因素密切相关.EZH2及其共表达基因主要参与了核碱基的调节、细胞周期调控、染色体分离、DNA复制、DNA修复等生物学过程,并参与了细胞周期、DNA复制、M/G1期转化、M期、有丝分裂前中期、ATM通路等生物学通路.此外