目的:通过生物信息学筛选与口腔鳞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)预后显著相关的miRNA,并通过体外实验进行验证.方法:从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)下载OSCC患者数据.通过R分析差异表达的miRNA.使用回归分析建立风险模型.通过Kaplan-Meier生存分析预测OSCC患者预后.通过受试者操作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线及回归分析验证风险模型可靠性.使用GO和KEGG分析预测预后相关miRNA的生物学功能.通过qRT-PCR及Western blot对生物信息学结果进行体外验证.结果:20个miRNA在OSCC中差异表达;miR-204-5p及miR-503-3p与OSCC预后显著相关;本研究构建的风险模型能有效预测OSCC预后;GO分析显示miR-204-5p与细胞凋亡、增殖及迁徙相关,而miR-503-3p与细胞分化、细胞周期及GTP结合有关;KEGG分析显示miR-204-5p与PI3K/Akt/mTOR通路及自噬通路相关,而miR-503-3p与Ras通路及HIF-1通路相关;qRT-PCR显示OSCC细胞中miR-204-5p表达量下降(P<0.05),瞬时转染miR-204-5p mimic后OSCC细胞中miR-204-5p表达量明显升高(P<0.05);Western blot显示升高miR-204-5p后OSCC细胞中PIK3CB表达量明显下降(P<0.05).结论:miR-204-5p及miR-503-3p是OSCC中有效的预后生物标志物.miR-204-5p及miR-50
作者:苟秋童;谢强;靳文珂;廖敏茹;李自祥;黄海霞
来源:现代肿瘤医学 2023 年 31卷 16期