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目的 通过UHPLC-Q-Orbitrap HRMS技术明确经典名方三仁汤中的主要化学成分,并通过网络药理学进一步探讨其治疗新型冠状病毒肺炎的作用机制.方法 根据UHPLC-Q-Orbitrap HRMS技术得到的二级质谱裂解碎片信息,对三仁汤进行分析鉴定.在PubChem数据库中下载质谱定性分析出的化合物的 2D结构,导入Swiss ADME 平台进行初步筛选,并借助Swiss Target Prediction数据库寻找三仁汤潜在作用靶点.通过Gene Cards数据库检索与新型冠状病毒肺炎(Corona virus disease 2019,COVID-19)相关的疾病靶点.使用Draw Venn Diagram网站,获取三仁汤和COVID-19 共同作用的靶点.使用STRING数据库构建共同靶点互作网络(PPI),Cytoscape 3.7.2 软件构建三仁汤"中药-活性成分-靶点-疾病"网络图.最后通过Metascape平台对三仁汤治疗COVID-19 相关靶点进行KEGG和GO富集分析.结果通过质谱法从三仁汤8 味中药中鉴定了37 种化学成分.进一步筛选出22 个活性成分,将三仁汤的533 个潜在作用靶点与COVID-19 的482 个COVID-19 靶点基因的靶点进行交集,得到了58 个共同靶点,其中出现频次较高的有AVEGFA、EGFR、IL-6、AKT1、JUN、ICAM1 等.通过GO富集分析得到了551 条(P<0.05)信号通路,KEGG富集分析得到了 118 条(P<0.05)信号通路,其基因数目在与炎

作者:邓丹萍;谢天喜;刘向儒;孙志;薛连平;周胜楠;何平;曾祥嵩;唐晓涛;方艳琳;陈路军;彭小飞

来源:陕西中医药大学学报 2023 年 46卷 5期

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作者:
邓丹萍;谢天喜;刘向儒;孙志;薛连平;周胜楠;何平;曾祥嵩;唐晓涛;方艳琳;陈路军;彭小飞
来源:
陕西中医药大学学报 2023 年 46卷 5期
标签:
新型冠状病毒肺炎(COVID-19) 三仁汤 UHPLC-Q-Orbitrap HRMS技术 网络药理学
目的 通过UHPLC-Q-Orbitrap HRMS技术明确经典名方三仁汤中的主要化学成分,并通过网络药理学进一步探讨其治疗新型冠状病毒肺炎的作用机制.方法 根据UHPLC-Q-Orbitrap HRMS技术得到的二级质谱裂解碎片信息,对三仁汤进行分析鉴定.在PubChem数据库中下载质谱定性分析出的化合物的 2D结构,导入Swiss ADME 平台进行初步筛选,并借助Swiss Target Prediction数据库寻找三仁汤潜在作用靶点.通过Gene Cards数据库检索与新型冠状病毒肺炎(Corona virus disease 2019,COVID-19)相关的疾病靶点.使用Draw Venn Diagram网站,获取三仁汤和COVID-19 共同作用的靶点.使用STRING数据库构建共同靶点互作网络(PPI),Cytoscape 3.7.2 软件构建三仁汤"中药-活性成分-靶点-疾病"网络图.最后通过Metascape平台对三仁汤治疗COVID-19 相关靶点进行KEGG和GO富集分析.结果通过质谱法从三仁汤8 味中药中鉴定了37 种化学成分.进一步筛选出22 个活性成分,将三仁汤的533 个潜在作用靶点与COVID-19 的482 个COVID-19 靶点基因的靶点进行交集,得到了58 个共同靶点,其中出现频次较高的有AVEGFA、EGFR、IL-6、AKT1、JUN、ICAM1 等.通过GO富集分析得到了551 条(P<0.05)信号通路,KEGG富集分析得到了 118 条(P<0.05)信号通路,其基因数目在与炎