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目的:分析肾癌、前列腺癌、膀胱癌和睾丸癌全基因组关联研究( GWAS)英文文献数据的构成特征。方法对国际最新GWAS研究数据库之一———美国国立人类基因组研究所( NHGRI)数据库进行数据挖掘。结果应用文献计量学方法,客观分析了NHGRI的文献基本特征、第一第二阶段样本量、染色体区域相关(核苷酸多态性) SNP、风险等位基因频率、P值文献中最强SNP、优势比(odds ratio,OR)或β相关系数、实验平台及检测SNP数量8项数据,找出了泌尿生殖系统肿瘤GWAS的一些共性特征。结论8号染色体区域SNP多态性,可能是泌尿生殖系统肿瘤遗传易感区域,深入此易感区域研究,可能为阐述肿瘤发生、治疗及预后评估提供一定线索。

作者:田玉旺;许春伟;方美玉

来源:实用癌症杂志 2014 年 12期

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作者:
田玉旺;许春伟;方美玉
来源:
实用癌症杂志 2014 年 12期
标签:
全基因组关联研究 文献研究 数据挖掘 Genome-wide Association Study ( GWAS) Literature research Data Mining
目的:分析肾癌、前列腺癌、膀胱癌和睾丸癌全基因组关联研究( GWAS)英文文献数据的构成特征。方法对国际最新GWAS研究数据库之一———美国国立人类基因组研究所( NHGRI)数据库进行数据挖掘。结果应用文献计量学方法,客观分析了NHGRI的文献基本特征、第一第二阶段样本量、染色体区域相关(核苷酸多态性) SNP、风险等位基因频率、P值文献中最强SNP、优势比(odds ratio,OR)或β相关系数、实验平台及检测SNP数量8项数据,找出了泌尿生殖系统肿瘤GWAS的一些共性特征。结论8号染色体区域SNP多态性,可能是泌尿生殖系统肿瘤遗传易感区域,深入此易感区域研究,可能为阐述肿瘤发生、治疗及预后评估提供一定线索。