目的 本文主要研究近几年来NCBI数据库最新释放出来的8种新型HPV即HPV(126,135,136,137,140,144,154,166),对其进行分子进化树分析,进行分类并设计特异型引物. 方法 NCBI检索8种新型HPV的基因组序列,然后用Blast相似性比较得到与其L1高度相似的HPV,其次选择HPV αβγ各属具代表性的HPV,最后用Clustal W对以上所有58种HPV L1区氨基酸序列进行比较分析,构建分子进化树;进一步用Primer-Blast对8种新型HPV进行特异型引物设计. 结果 系统进化树分析得出8种HPV均属于γ属,利用Primer-Blast分析得到这8种HPV特异型引物.结论 HPV126、HPV135、HPV136、HPV137、HPV140、HPV144、HPV154、HPV166均为γ属.
作者:王启广;谌芳;曹友德
来源:实用预防医学 2016 年 23卷 1期