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目的 探究天津中医药大学第一附属医院中药结肠透析方(大黄、牡蛎、蒲公英)治疗慢性肾脏病(CKD)的作用机制.方法 使用BATMAN-TCM收集大黄、牡蛎、蒲公英三味中药的化学成分和相关靶点,在DisGeNet、DrugBank等数据库检索CKD疾病靶点.选用Venny数据库获取药物-疾病交集靶点后,将其导入STRING数据库并利用Cytoscape 3.9.1软件进行可视化;在DAVID数据库对交集靶点进行GO功能和KEGG富集分析;最后运用Pymol、AutoDock等软件进行分子对接验证.结果 得到234个药物-疾病交集靶点,其中MAPK1、AKT1、PIK3R1等18个靶点为核心靶点,GO富集分析得到770个结果(P<0.01,FDR<0.05),包括610条生物过程,65条细胞组成,95条分子功能,其主要作用于质膜、细胞质、胞质等功能位置.KEGG富集分析主要涉及炎性反应、免疫抑制、糖脂代谢等,其中与PI3K-Akt信号通路联系最为紧密.分子对接结果显示核心靶点与活性成分结合稳定,靶点AKT1与黄体酮的结合能最高(-10.759).结论 研究初步验证了中医结肠透析治疗慢性肾脏病具有"多途径、多通路、多靶点"的特点,以期为更深层次的实验研究和临床诊疗提供思路.

作者:向雪芹;赵菁莉;赵晰

来源:实用中医内科杂志 2023 年 37卷 8期

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作者:
向雪芹;赵菁莉;赵晰
来源:
实用中医内科杂志 2023 年 37卷 8期
标签:
慢性肾脏病 中药结肠透析 下法 生物信息学 分子对接 chronic kidney disease traditional Chinese medicine colon dialysis prescription purgative method bioinformat-ics molecular docking
目的 探究天津中医药大学第一附属医院中药结肠透析方(大黄、牡蛎、蒲公英)治疗慢性肾脏病(CKD)的作用机制.方法 使用BATMAN-TCM收集大黄、牡蛎、蒲公英三味中药的化学成分和相关靶点,在DisGeNet、DrugBank等数据库检索CKD疾病靶点.选用Venny数据库获取药物-疾病交集靶点后,将其导入STRING数据库并利用Cytoscape 3.9.1软件进行可视化;在DAVID数据库对交集靶点进行GO功能和KEGG富集分析;最后运用Pymol、AutoDock等软件进行分子对接验证.结果 得到234个药物-疾病交集靶点,其中MAPK1、AKT1、PIK3R1等18个靶点为核心靶点,GO富集分析得到770个结果(P<0.01,FDR<0.05),包括610条生物过程,65条细胞组成,95条分子功能,其主要作用于质膜、细胞质、胞质等功能位置.KEGG富集分析主要涉及炎性反应、免疫抑制、糖脂代谢等,其中与PI3K-Akt信号通路联系最为紧密.分子对接结果显示核心靶点与活性成分结合稳定,靶点AKT1与黄体酮的结合能最高(-10.759).结论 研究初步验证了中医结肠透析治疗慢性肾脏病具有"多途径、多通路、多靶点"的特点,以期为更深层次的实验研究和临床诊疗提供思路.