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应用网络药理学及分子对接技术,探讨土家药复方竹节参片治疗肝损伤(Liver injury,LI)的物质基础及作用机制.从TCMSP数据库和中国知网数据库中提取复方竹节参片的化合物及靶点信息;Uniprot网站将靶点信息转换为Gene,将中药-成分-Gene信息导入Cytoscape V3.8.2获得中药-成分-Gene网络;利用OMIM、GeneCards和DrugBank网站提取"Liver injury"的疾病Gene,Excel绘制Venn图获得成分-疾病交集靶点,并构建交集靶点-成分网络图确定核心成分;利用STRING网站获得交集靶点的蛋白互作(PPI)网络及核心靶点,Matascape网站对核心靶点进行基因本体(GO)功能、京都基因和基因组数据库(KEGG)通路富集分析;用AutoDock工具进行核心成分与核心靶点的分子对接.复方竹节参片中共筛选出68种有效活性成分,治疗LI的核心成分有槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、木犀草素、(20S)-原人参二醇和β-胡萝卜素等;治疗LI的核心靶点15个,分别为STAT3、JUN、AKT1、TP53、TNF、MAPK1、IL6、RELA、VEGFA、MAPK8、MAPK14、PIK3CA、MYC、CTNNB1 和 FOS.靶点主要涉及调节与 DNA 结合的转录因子活性、蛋白激酶活性、细胞氧化应激及炎症反应、癌症相关蛋白的表达和血管生长等生物学过程;重要通路有乙型和丙型肝炎病毒途径、癌症及癌症中的蛋白多糖、流体剪切

作者:宋添力;孙永章;李奇;刘立安;唐浪;刘绪;黄胜

来源:特产研究 2023 年 45卷 4期

知识库介绍

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宋添力;孙永章;李奇;刘立安;唐浪;刘绪;黄胜
来源:
特产研究 2023 年 45卷 4期
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复方竹节参片 肝损伤 网络药理学 分子对接 作用机制 Fufang Panax japonicus tablets liver injury network pharmacology molecular docking mechanism of action
应用网络药理学及分子对接技术,探讨土家药复方竹节参片治疗肝损伤(Liver injury,LI)的物质基础及作用机制.从TCMSP数据库和中国知网数据库中提取复方竹节参片的化合物及靶点信息;Uniprot网站将靶点信息转换为Gene,将中药-成分-Gene信息导入Cytoscape V3.8.2获得中药-成分-Gene网络;利用OMIM、GeneCards和DrugBank网站提取"Liver injury"的疾病Gene,Excel绘制Venn图获得成分-疾病交集靶点,并构建交集靶点-成分网络图确定核心成分;利用STRING网站获得交集靶点的蛋白互作(PPI)网络及核心靶点,Matascape网站对核心靶点进行基因本体(GO)功能、京都基因和基因组数据库(KEGG)通路富集分析;用AutoDock工具进行核心成分与核心靶点的分子对接.复方竹节参片中共筛选出68种有效活性成分,治疗LI的核心成分有槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、木犀草素、(20S)-原人参二醇和β-胡萝卜素等;治疗LI的核心靶点15个,分别为STAT3、JUN、AKT1、TP53、TNF、MAPK1、IL6、RELA、VEGFA、MAPK8、MAPK14、PIK3CA、MYC、CTNNB1 和 FOS.靶点主要涉及调节与 DNA 结合的转录因子活性、蛋白激酶活性、细胞氧化应激及炎症反应、癌症相关蛋白的表达和血管生长等生物学过程;重要通路有乙型和丙型肝炎病毒途径、癌症及癌症中的蛋白多糖、流体剪切