目的:通过生物信息学方法筛选多囊卵巢综合征(PCOS)的关键基因并分析其与PCOS进展和预后的相关性.方法:在GEO数据库中下载GSE34526 数据集的表达谱,利用R软件筛选数据集中PCOS患者卵巢颗粒细胞(n=7)和正常颗粒细胞(n=3)的差异表达基因(DEGs),对DEGs进行基因本体论(GO)和京都百科全书基因和基因组(KEGG)富集分析,识别关键基因.使用单样本基因富集分析(ssGSEA)评分量化每个PCOS样本中的免疫信号的富集水平,进行抗肿瘤免疫和促肿瘤抑制评分.利用人类蛋白质图谱数据库(HPA)分析关键基因在卵巢癌(OC)、乳腺癌(BRCA)和子宫内膜癌(UCEC)中的蛋白表达水平,绘制ROC曲线分析 3 年、5 年和 10 年癌症生存率.结果:本研究共筛选出 16 个DEGs,GO和KEGG分析结果显示DEGs在PCOS患者的细胞黏附分子(CAMs)、补体和凝血级联、上皮细胞迁移和炎症反应的正向调控等通路中富集,进一步筛选出 2 个关键基因,ITGAM和HMOX1.二者与促炎免疫细胞(如巨噬细胞、MDSCs、中性粒细胞、浆细胞样树突状细胞、调节性T细胞)的相关性分析显示,ITGAM(P分别为 0.001、<0.001、0.051、0.04、<0.001)和HMOX1(P分别为<0.001、0.001、<0.001、<0.001、0.001)与以上促炎免疫细胞呈正相关,即发挥促炎作用.在OC、BRCA和UCEC组织中,ITGAM和HMOX1蛋白水平较

作者：孙奎奎；杨微微；王文靖；郝颖新；郭波；任晨春；鞠明艳

来源：天津医科大学学报 2023 年 29卷 6期