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以慢性阻塞性肺病(COPD)和支气管哮喘为示范,运用网络药理学和分子对接技术探究甘草抗糖皮质激素耐药的分子机制.通过TCMSP数据库检索甘草潜在有效成分和作用靶点,利用Uniprot数据库查询靶点对应基因,并利用Cytoscape3.9.1 软件构建成分-靶点(基因)可视化网络.应用GeneCards、OMIM、NCBI-gene数据库检索糖皮质激素耐药靶点或不敏感靶点(glucocorticoid resistance target or insensitive target,GROI)、COPD靶点、哮喘靶点,在String数据库构建交集靶点的蛋白互作(PPI)网络,并通过Centiscape2.2 计算得到核心靶点,利用Metascape数据库对核心靶点进行富集分析,采用分子对接技术对潜在有效成分和目标蛋白进行验证.共获得甘草成分 87 个及其对应靶点 230 个、GROI靶点基因 3 992 个、COPD靶点基因 791 个、哮喘作用靶点基因 1 988 个.核心靶点基因为IL6、TP53、VEGFA、MMP9 和JUN等.甘草发挥作用的潜在有效成分为槲皮素、山奈酚、柚皮素和芒柄花素等.GO分析结果表明,甘草抗糖皮质激素耐药机制主要涉及氧化应激、生长因子刺激、细胞增殖、迁移、死亡、分化、DNA结合转录因子活性的调节等生物学过程.KEGG通路富集分析表明,甘草通过调节脂质及动脉粥样硬化通路、MAPK信号通路、HIF-1 信号通路和FoxO信号通路等发

作者:任小薇;刘旭洋;李金鑫;杨柳;蔡邦荣

来源:天津师范大学学报(自然科学版) 2023 年 43卷 6期

知识库介绍

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任小薇;刘旭洋;李金鑫;杨柳;蔡邦荣
来源:
天津师范大学学报(自然科学版) 2023 年 43卷 6期
标签:
甘草 糖皮质激素耐药性 慢性阻塞性肺疾病 支气管哮喘 网络药理学 分子对接 licorice glucocorticoid resistance chronic obstructive pulmonary disease asthma network pharmacology mo-lecular docking
以慢性阻塞性肺病(COPD)和支气管哮喘为示范,运用网络药理学和分子对接技术探究甘草抗糖皮质激素耐药的分子机制.通过TCMSP数据库检索甘草潜在有效成分和作用靶点,利用Uniprot数据库查询靶点对应基因,并利用Cytoscape3.9.1 软件构建成分-靶点(基因)可视化网络.应用GeneCards、OMIM、NCBI-gene数据库检索糖皮质激素耐药靶点或不敏感靶点(glucocorticoid resistance target or insensitive target,GROI)、COPD靶点、哮喘靶点,在String数据库构建交集靶点的蛋白互作(PPI)网络,并通过Centiscape2.2 计算得到核心靶点,利用Metascape数据库对核心靶点进行富集分析,采用分子对接技术对潜在有效成分和目标蛋白进行验证.共获得甘草成分 87 个及其对应靶点 230 个、GROI靶点基因 3 992 个、COPD靶点基因 791 个、哮喘作用靶点基因 1 988 个.核心靶点基因为IL6、TP53、VEGFA、MMP9 和JUN等.甘草发挥作用的潜在有效成分为槲皮素、山奈酚、柚皮素和芒柄花素等.GO分析结果表明,甘草抗糖皮质激素耐药机制主要涉及氧化应激、生长因子刺激、细胞增殖、迁移、死亡、分化、DNA结合转录因子活性的调节等生物学过程.KEGG通路富集分析表明,甘草通过调节脂质及动脉粥样硬化通路、MAPK信号通路、HIF-1 信号通路和FoxO信号通路等发