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目的 研究肝癌免疫细胞的浸润模式,探索免疫细胞浸润与预后的关系.方法 从TCGA数据库下载肝细胞癌转录本数据及相关临床数据,通过Cibersort软件的反卷积法计算22种免疫细胞的占比.采用K-M生存分析Log-Rank法计算每种免疫细胞与生存的相关性.结果 从TCGA数据库中得到基因转录本数据共424例,包含肝癌组织374例、正常肝组织50例.每个样本检测基因位点60483个,包含mRNA 19658个.数据校正后使用Cibersort软件"反卷积法"得到22种免疫细胞的占比数据,采用P<0.05筛选样本,得到肝细胞癌组织40例、正常肝组织2例.K-M生存分析显示活化的肥大细胞、未活化的自然杀伤细胞、嗜酸性粒细胞组成比例高者预后差,活化的自然杀伤细胞比例高者预后更好.结论 肝癌中存在各类免疫细胞不同程度的浸润,浸润性免疫细胞可以作为影响肝癌患者预后的因素.

作者:程熠;吴莹莹;刘东伯;郭秋云

来源:华中科技大学学报(医学版) 2019 年 48卷 3期

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作者:
程熠;吴莹莹;刘东伯;郭秋云
来源:
华中科技大学学报(医学版) 2019 年 48卷 3期
标签:
肝癌 免疫细胞浸润 预后
目的 研究肝癌免疫细胞的浸润模式,探索免疫细胞浸润与预后的关系.方法 从TCGA数据库下载肝细胞癌转录本数据及相关临床数据,通过Cibersort软件的反卷积法计算22种免疫细胞的占比.采用K-M生存分析Log-Rank法计算每种免疫细胞与生存的相关性.结果 从TCGA数据库中得到基因转录本数据共424例,包含肝癌组织374例、正常肝组织50例.每个样本检测基因位点60483个,包含mRNA 19658个.数据校正后使用Cibersort软件"反卷积法"得到22种免疫细胞的占比数据,采用P<0.05筛选样本,得到肝细胞癌组织40例、正常肝组织2例.K-M生存分析显示活化的肥大细胞、未活化的自然杀伤细胞、嗜酸性粒细胞组成比例高者预后差,活化的自然杀伤细胞比例高者预后更好.结论 肝癌中存在各类免疫细胞不同程度的浸润,浸润性免疫细胞可以作为影响肝癌患者预后的因素.