目的 生物信息学方法筛选miRNA用于原发性肝癌的早期诊断.方法 从肿瘤基因组数据库TCGA下载原发性肝癌组织miRNA表达情况数据,成组t检验进行miRNA表达水平的比较,获得表达水平差异2倍以上的miRNA.靶点预测工具miRWalk 2.0分析上述miRNA的靶基因,c-Bioportal数据库获取原发性肝癌常见突变基因,miRNA靶基因中含有肝癌突变基因者定为备选,结合文献报道确定目标miRNA.结果 TCGA数据包含原发性肝癌组织372例,正常对照肝组织50例,共有1 881条miRNA序列,肝癌组织中表达升高至2倍以上的miRNA有41个,降低至1/2以下的miRNA有115个. c-Bioportal数据库获得原发性肝癌突变基因68个(发生率>5
作者：赵西太；聂青和
来源：胃肠病学和肝病学杂志 2018 年 27卷 6期
