目的:通过生物信息学分析确定长链非编码RNA HOTAIR(HOTAIR)作为肺鳞癌(LUSC)预后生物标记基因.方法:利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库分析HOTAIR在泛癌中的表达情况,根据中位数将数据分为高、低表达HOTAIR组,采用Kaplan-Meier法对两组患者进行生存分析并绘制生存曲线、利用linkedOmics数据库分析HOTAIR在LUSC中的临床特征关系及其共表达基因,利用TIMER软件验证不同HOTAIR mRNA表达水平与LUSC患者免疫细胞浸润的相关性,通过绘制受试者工作特征(ROC)曲线评估模型的准确性.结果:HOTAIR在多种类型癌症中表达较高,在配对及非配对LUSC样本中,HO-TAIR在肿瘤患者的表达均高于正常患者.ROC分析HOTAIR可作为LUSC的潜在的生物标志物,ROC曲线下面积(AUC)=0.883;HOTAIR的表达与病理阶段显著相关(P＜0.05);HOTAIR与LUSC患者的总体生存率(OS)、疾病特异性生存期(DSS)、无进展生存期(PFI)相关性无统计学意义;HOTAIR共表达的基因富集在多种免疫反应生物过程中.结论:HOTAIR在LUSC中表达上调,并且与不良生存预后显著相关,可作为LUSC的生物标记物和潜在的治疗靶点.
作者：殷国泉；吕坤
来源：皖南医学院学报 2023 年 42卷 5期
