[目的]以亚硝酸盐还原酶基因(nirS)为分子标记,探讨富营养化湖泊武汉东湖沉积物中NirS类反硝化细菌群落的多样性及系统发育,并分析环境因子对群落分布的影响.[方法]在武汉东湖4个典型子湖郭郑湖、汤菱湖、团湖和庙湖采集沉积物样品,测定环境参数;提取沉积物中微生物群落基因组DNA,分别构建4个子湖的反硝化微生物的nirS基因文库,利用限制性片段长度的多态性分析(Restriction Fragment LengthPolymorphism,RFLP)技术初步分群,确定各群的代表菌株并测定其nirS基因序列;利用DOTUR软件计算各群落多样性和丰富度指数,以Neighbor-Joining法构建供试菌与参比菌的系统发育树.[结果]环境参数测定结果表明东湖4个子湖中庙湖沉积物总氮(TN)和氨态氮(NH(4+-)N)含量最高,团湖最低,郭郑湖沉积物中NO3-浓度最高.基于NirS序列的生物多样性和丰富度分析表明团湖生物多样性和丰富度指数最高而庙湖各项指数均较低.各子湖供试序列及其代表序列综合RFLP聚类分析表明,武汉东湖沉积物中NirS类反硝化微生物种群具有丰富的多样性.NJ系统发育分析表明东湖沉积物NirS类反硝化菌群可分成3个较大群体(群Ⅰ-Ⅲ).群Ⅰ占总群体的67.7
作者：程占冰；杨江科；李鹤；朱兵；陈相军；闫云君
来源：微生物学报 2011 年 51卷 5期
