[目的]蜜蜂球囊菌(Ascosphaera apis,简称球囊菌)是一种能够侵染中华蜜蜂(Apis cerana cerana,简称中蜂)幼虫的致死性真菌病原.微小RNA (microRNA,miRNA)可通过在转录后水平靶向抑制或降解mRNA而参与宿主与病原互作过程.本研究旨在对球囊菌胁迫的中蜂6日龄幼虫肠道的差异表达miRNA (DEmiRNA)及其靶基因进行深入分析,进而揭示DEmiRNA在中蜂响应球囊菌胁迫应答过程中的作用.[方法]利用Illumina MiSeq平台对正常及球囊菌胁迫的中蜂6日龄幼虫肠道(AcCK和AcT)进行测序,通过相关生物信息学软件预测DEmiRNA及其靶基因.通过Blast将靶基因注释到GO和KEGG数据库.利用Cytoscape软件构建DEmiRNA与其靶mRNA的调控网络.通过Stem-loop RT-PCR和qPCR验证测序数据的可靠性.[结果]本研究共预测出537个miRNA,其长度分布介于16-35 nt之间,且不同长度的miRNA首位碱基偏向性差异明显.通过Stem-loop RT-PCR证实了10个novel miRNA的表达.AcCK vs AcT比较组共有54个DEmiRNA,包含3 1个上调和23个下调miRNA,可分别靶向结合6170和8199个靶基因.GO分类结果显示上调和下调miRNA的靶基因分别涉及47和47个条目,富集基因数最多的皆为结合细胞进程和催化活性.KEGG代谢通路(pathway)富集分析结果表明上调和下调miRNA的靶基因分别富集在134和1

作者：杜宇；童新宇；周丁丁；陈大福；熊翠玲；郑燕珍；徐国钧；王海朋；陈华枝；郭意龙；隆琦；郭睿

来源：微生物学报 2019 年 59卷 9期