[目的]壳囊孢属(Cytospora)真菌引起的林木腐烂病和枝枯病,是一类重要的、分布广泛的枝干病害,可引起重大经济损失和生态破坏.通过全基因组测序和比较基因组学分析,探究不同腐烂病菌的全基因组特征,分析其与寄主选择和致病性相关的基因或基因家族的差异性,将有助于进一步揭示腐烂病菌与寄主互作的分子机制,为腐烂病的有效防治提供基础资料.[方法]采用PacBio测序技术对云杉腐烂病菌Cytospora piceae进行了全基因组测序和组装,并通过比较基因组学方法,从基因组水平探究引起腐烂病的4种腐烂病菌的基因组的差异,分析其共有的和特有的与致病相关的基因家族.[结果]C.piceae基因组大小为39.25 Mb,GC含量为51.79％.基于单拷贝直系同源基因构建的系统发育树显示,C.piceae与Cytospora chrysosperma的进化关系相近,Valsa mali和Valsa pyri则更相近.比较基因组学分析表明,4种腐烂病菌均具有重复诱导的点突变(RIP)活性,其中,C.piceae的RIP活性最强.与其他3种腐烂病菌相似,与木质素降解相关的AA3和AA7家族在C.piceae中显著扩张,但木质素降解关键酶AA5家族均缺失;C.piceae和C.chrysosperma基因组中果胶降解关键酶GH28和CE8家族基因的数量与V.mali和V.pyri相近.4种腐烂病菌都含有较多数量的MFS (major facilitator superf
作者：周文秀；田呈明；游崇娟
来源：微生物学报 2021 年 61卷 10期
