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目的 利用分子生物学方法,对25株6群肺炎链球菌荚膜多糖合成相关基因(cps loci)进行研究.方法 采用多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)技术,对25株6群肺炎链球菌进行分型;依据GenBank中收录的6群肺炎链球菌cpsloci设计合成引物,以25株肺炎链球菌基因组DNA作为模板进行PCR扩增,并对扩增产物进行基因测定及分析;采用相邻合并分析(neighbour-joining analysis),根据MLST的7个管家基因和wciP、wzy、必这三个cps loci的代表基因分别绘制出系统发育树.结果 根据MLST技术分析发现7株新的ST型菌株.25株6群肺炎链球菌cps1oci的G+C含量为35.4% ~35.5%,均属于Ⅰ类;所有6C型wzy基因均有6个碱基的缺失.根据MLST的7个管家基因绘制的系统发育树,并根据cps loci的3个代表基因wciP、wzy和wzx绘制的系统发育树,差异很大.3个代表基因绘制的系统发育树,6C型为进化距离比较远的分枝,6A型和6B型的分枝进化距离相对较近;6D型与6B型在同一分枝内.结论 获得了25株6群肺炎链球菌ST型和全长cps loci,完善了6群肺炎链球菌的菌种档案.

作者:陈琼;龙新星;李红;黄洋;王春娥;陈翠萍;叶强

来源:微生物学免疫学进展 2017 年 45卷 4期

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作者:
陈琼;龙新星;李红;黄洋;王春娥;陈翠萍;叶强
来源:
微生物学免疫学进展 2017 年 45卷 4期
标签:
肺炎链球菌 荚膜多糖合成相关基因 多位点序列分型 系统发育树
目的 利用分子生物学方法,对25株6群肺炎链球菌荚膜多糖合成相关基因(cps loci)进行研究.方法 采用多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)技术,对25株6群肺炎链球菌进行分型;依据GenBank中收录的6群肺炎链球菌cpsloci设计合成引物,以25株肺炎链球菌基因组DNA作为模板进行PCR扩增,并对扩增产物进行基因测定及分析;采用相邻合并分析(neighbour-joining analysis),根据MLST的7个管家基因和wciP、wzy、必这三个cps loci的代表基因分别绘制出系统发育树.结果 根据MLST技术分析发现7株新的ST型菌株.25株6群肺炎链球菌cps1oci的G+C含量为35.4% ~35.5%,均属于Ⅰ类;所有6C型wzy基因均有6个碱基的缺失.根据MLST的7个管家基因绘制的系统发育树,并根据cps loci的3个代表基因wciP、wzy和wzx绘制的系统发育树,差异很大.3个代表基因绘制的系统发育树,6C型为进化距离比较远的分枝,6A型和6B型的分枝进化距离相对较近;6D型与6B型在同一分枝内.结论 获得了25株6群肺炎链球菌ST型和全长cps loci,完善了6群肺炎链球菌的菌种档案.