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[目的]随着中国奶牛业的发展,干草需求量与日俱增.作为天然牧草,干草可以成为家畜传播病原体的载体.以干草表面附着物为研究对象,了解干草中细菌群落结构以及致病菌属特征.[方法]对来自6个不同奶牛场饲草舍的干草样本,应用Illumina MiSeq高通量测序技术测定干草表面附着物细菌的16S rRNA基因V3-V4变异区序列,分析不同干草样本细菌群落组成.[结果]干草样本中的细菌在97%的相似水平下共得到OTU个数为15 416,涵盖了29门87纲144目219科323属的细菌.微生物多样性分析表明,干草样本具有很高的细菌多样性,不同样本多样性存在差异.对干草样本茵群中丰度较高的14种病原菌属进行分析,发现相较于人工种植牧草制备的干草,天然牧草制备的干草中病原茵属丰度较高.[结论]研究解析了干草样本中微生物的多样性、丰度及主要病原菌属的特征,对奶牛场疾病防控有一定指导意义.

作者:张阁;孙翠丽;彭永;程汝佳;杨宏军;朱良全;胡莉萍;丁家波

来源:微生物学通报 2017 年 44卷 12期

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作者:
张阁;孙翠丽;彭永;程汝佳;杨宏军;朱良全;胡莉萍;丁家波
来源:
微生物学通报 2017 年 44卷 12期
标签:
干草 微生物群落及多样性 MiSeq测序 Hay Microbial community structure and diversity MiSeq sequencing
[目的]随着中国奶牛业的发展,干草需求量与日俱增.作为天然牧草,干草可以成为家畜传播病原体的载体.以干草表面附着物为研究对象,了解干草中细菌群落结构以及致病菌属特征.[方法]对来自6个不同奶牛场饲草舍的干草样本,应用Illumina MiSeq高通量测序技术测定干草表面附着物细菌的16S rRNA基因V3-V4变异区序列,分析不同干草样本细菌群落组成.[结果]干草样本中的细菌在97%的相似水平下共得到OTU个数为15 416,涵盖了29门87纲144目219科323属的细菌.微生物多样性分析表明,干草样本具有很高的细菌多样性,不同样本多样性存在差异.对干草样本茵群中丰度较高的14种病原菌属进行分析,发现相较于人工种植牧草制备的干草,天然牧草制备的干草中病原茵属丰度较高.[结论]研究解析了干草样本中微生物的多样性、丰度及主要病原菌属的特征,对奶牛场疾病防控有一定指导意义.