[背景]H5N1禽流感病毒可以感染人类导致重症呼吸道感染,致死率高.[目的]研究我中心确认的一例人感染高致病性禽流感H5N1病毒A/Nanjing/1/2015的可能起源及基因组分子特征.[方法]对病人痰液样本中的H5N1病毒进行全基因组测序,使用CLC Genomics Workbench 9.0对序列进行拼接,使用BLAST和MEGA 5.22软件进行同源性比对和各片段分子特征分析.[结果]该株禽流感病毒属于H5亚型的2.3.2.1c家系,其8个片段均与江浙地区禽类中分离的病毒高度同源,未发现有明显的重配.分子特征显示,该病毒血凝素(Hemagglutinin,HA)蛋白裂解位点为PQRERRRR/G,受体结合位点呈现禽类受体特点,但出现D94N、S133A和T188I氨基酸置换增强了病毒对人类受体的亲和性.神经氨酸酶(Neuraminidase,NA)蛋白颈部在49-68位缺失20个氨基酸,非结构蛋白1 (Non-structure protein,NS1)存在P42S置换和80-84位氨基酸的缺失.其他蛋白中也存在多个增强病毒致病力和对人类细胞亲和力的氨基酸突变.对耐药位点分析发现存在对奥司他韦的耐药突变H274Y,病毒对金刚烷胺仍旧敏感.[结论]人感染高致病性禽流感H5N1病毒A/Nanjing/1/2015属于2.3.2.1c家系,禽类来源,关键位点较保守,但仍出现了多个氨基酸的进化与变异使其更利于感染人类.H5N1禽流感病毒进化活跃,持续动态监
作者:雍玮;乔梦凯;石利民;王璇;何敏;丁洁
来源:微生物学通报 2019 年 46卷 11期