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目的 对禽流感H5N1亚型病毒株A/Chicken/Hubei/489/2004的全基因组进行克隆和测序,并分析血凝素基因HA的遗传突变特点及其与1996年以来其他病毒株的亲缘关系.方法 通过RT-PCR扩增病毒株A/C hicken/Hubei/489/2004的8个基因,并将其克隆到测序载体;在对病毒株全基因组序列测定基础上,利用生物信息学软件对HA基因进行遗传进化分析.结果 病毒株A/Chicken/Hubei/489/2004的全基因组克隆到PMD18-T;遗传进化分析显示该毒株HA蛋白具有与致病性有关的切割位点“PQRERRRKKR”,并且与2000~2006年在香港从人和禽体内分离的H5N1亲缘关系相近,也与2003~2004年在东南亚从人和禽体内分离的H5N1极其相关.结论 A/Chicken/H ubei/489/2004病毒分离株具有与A/Chicken/Hong Kong/YU777/2002更相似的遗传特性,极可能是2002年禽流感病毒家系的再次出现.

作者:徐军强;吴叔文;詹发先;喻明霞;江永忠;霍细香

来源:卫生研究 2011 年 40卷 5期

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作者:
徐军强;吴叔文;詹发先;喻明霞;江永忠;霍细香
来源:
卫生研究 2011 年 40卷 5期
标签:
禽流感病毒A型 H5N1 克隆 遗传进化分析
目的 对禽流感H5N1亚型病毒株A/Chicken/Hubei/489/2004的全基因组进行克隆和测序,并分析血凝素基因HA的遗传突变特点及其与1996年以来其他病毒株的亲缘关系.方法 通过RT-PCR扩增病毒株A/C hicken/Hubei/489/2004的8个基因,并将其克隆到测序载体;在对病毒株全基因组序列测定基础上,利用生物信息学软件对HA基因进行遗传进化分析.结果 病毒株A/Chicken/Hubei/489/2004的全基因组克隆到PMD18-T;遗传进化分析显示该毒株HA蛋白具有与致病性有关的切割位点“PQRERRRKKR”,并且与2000~2006年在香港从人和禽体内分离的H5N1亲缘关系相近,也与2003~2004年在东南亚从人和禽体内分离的H5N1极其相关.结论 A/Chicken/H ubei/489/2004病毒分离株具有与A/Chicken/Hong Kong/YU777/2002更相似的遗传特性,极可能是2002年禽流感病毒家系的再次出现.