目的 从自噬角度对英夫利昔单抗(infliximab,IFX)治疗类风湿性关节炎(rheumatoid arthritis,RA)不应答基因数据芯片进行生物信息学分析,筛选IFX不应答相关特征基因,并初步研究特征基因对细胞自噬的影响,探讨IFX治疗RA不应答的可能机制.方法 利用R语言对筛选出的GEO(gene expression omnibus database)数据集进行自噬相关基因的差异表达分析,使用单因素logistic回归、Lasso(least absolute shrinkage and selection operator)回归、多因素logistic回归对差异自噬相关基因进行筛选,得到IFX治疗RA不应答的特征自噬基因,利用受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve,ROC)对特征自噬基因进行诊断价值分析.Real-time PCR检测特征基因在RA临床样本中的表达,Western blotting检测特征基因对RA滑膜细胞系MH7A细胞自噬的影响.结果 部分自噬相关基因在IFX治疗RA不应答者与应答者间差异表达(P<0.05),自噬相关基因集主要高表达于不应答组.筛选出HGS(hepatocyte growth factor-regulated tyrosine kinase substrate)和ATG4B(autophagy related 4 homolog B)作为IFX治疗RA不应答的特征基因.ROC曲线显示,使用该特征基因构建的预测模型在内部验证数据集GSE78068(AUC=0.708,P<0.05)和外部验证数据集GSE

作者：李渊博；李小建；张静涛；王洋；强毅；张波；吕昌伟

来源：西安交通大学学报（医学版） 2021 年 42卷 6期