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目的 采用网络药理学和分子对接的方法探讨右归丸治疗膝骨关节炎(KOA)的作用机制.方法 通过检索计算机系统生物学实验室(TCMSP)数据库获取右归丸的活性成分,利用TCMSP、SwissTargetPrediction和TargetNet预测活性成分的靶点,并从中医药整合药理学研究平台(TCMIP)、CTD、DisGeNET和GeneCards数据库检索KOA相关靶点,再与右归丸活性成分靶点取交集,获取右归丸治疗KOA的疗效相关靶点;进而通过DrugBank数据库检索美国食品药品监督管理局(FDA)批准的KOA治疗药物及其靶点,利用Cytoscape构建药物-靶点网络,再以STRING数据库构建蛋白相互作用网络(PPI)并进行网络基因的基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,构建中药-活性成分-关键靶点-显著通路-生物过程网络.结果 共获取右归丸组方中9味植物药的活性成分158个,对应490个目标靶点,其中76个靶点为右归丸潜在治疗靶点;在这76个靶点中,有13个与FDA批准的5个治疗KOA的西药的靶点相同;通过蛋白质相互作用(PPI)筛选出18个关键靶点;GO富集分析得到生物学过程1281条、分子功能60条以及细胞组分17条,主要与炎症反应、感染以及氧化应激过程相关;KEGG富集分析得出50条显著富集的通路,主要为IL-17信号通路、肿瘤坏死因子信号通路等,其功能主要涉及免疫系统

作者:刘小沛;谭从娥;沈霞;王相东;邢文文

来源:西安交通大学学报(医学版) 2022 年 43卷 3期

知识库介绍

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作者:
刘小沛;谭从娥;沈霞;王相东;邢文文
来源:
西安交通大学学报(医学版) 2022 年 43卷 3期
标签:
右归丸 膝骨关节炎(KOA) 网络药理学 分子对接 作用机制
目的 采用网络药理学和分子对接的方法探讨右归丸治疗膝骨关节炎(KOA)的作用机制.方法 通过检索计算机系统生物学实验室(TCMSP)数据库获取右归丸的活性成分,利用TCMSP、SwissTargetPrediction和TargetNet预测活性成分的靶点,并从中医药整合药理学研究平台(TCMIP)、CTD、DisGeNET和GeneCards数据库检索KOA相关靶点,再与右归丸活性成分靶点取交集,获取右归丸治疗KOA的疗效相关靶点;进而通过DrugBank数据库检索美国食品药品监督管理局(FDA)批准的KOA治疗药物及其靶点,利用Cytoscape构建药物-靶点网络,再以STRING数据库构建蛋白相互作用网络(PPI)并进行网络基因的基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,构建中药-活性成分-关键靶点-显著通路-生物过程网络.结果 共获取右归丸组方中9味植物药的活性成分158个,对应490个目标靶点,其中76个靶点为右归丸潜在治疗靶点;在这76个靶点中,有13个与FDA批准的5个治疗KOA的西药的靶点相同;通过蛋白质相互作用(PPI)筛选出18个关键靶点;GO富集分析得到生物学过程1281条、分子功能60条以及细胞组分17条,主要与炎症反应、感染以及氧化应激过程相关;KEGG富集分析得出50条显著富集的通路,主要为IL-17信号通路、肿瘤坏死因子信号通路等,其功能主要涉及免疫系统