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目的克隆幽门螺杆菌(Helicobacter pylori, Hp)4种黏附素(babA、alpA、alpB和hopZ)基因的保守区, 并对其进行序列及生物信息学分析.方法利用ANTHEPROT V4.3c 软件, 分析已证实的Hp 4种黏附素蛋白序列, 发现4种黏附素的C-端氨基酸存在保守区. 选取AlpA的C-端结构基因序列作为引物进行PCR, 将PCR产物定向插入载体pET-22b(+), 以DNA自动分析仪进行序列测定, 并以生物信息学软件分析其生物学特性.结果克隆片段的长度为588 bp, 与发表的黏附素AlpA保守区基因的序列完全一致.ANTHEPROT V4.3c软件预测其蛋白质的Mr约为22 500, 并显示出良好的抗原性和疏水性.结论用PCR方法, 从幽门螺杆菌ss1中获取到黏附素AlpA保守区的基因序列, 为研究Hp黏附素的分子机制和免疫原性奠定了基础.

作者:白杨;但汉雷;王继德;林焕健;张兆山;张亚历;周殿元

来源:细胞与分子免疫学杂志 2002 年 18卷 6期

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作者:
白杨;但汉雷;王继德;林焕健;张兆山;张亚历;周殿元
来源:
细胞与分子免疫学杂志 2002 年 18卷 6期
标签:
幽门螺杆菌 黏附素 序列分析 生物信息学
目的克隆幽门螺杆菌(Helicobacter pylori, Hp)4种黏附素(babA、alpA、alpB和hopZ)基因的保守区, 并对其进行序列及生物信息学分析.方法利用ANTHEPROT V4.3c 软件, 分析已证实的Hp 4种黏附素蛋白序列, 发现4种黏附素的C-端氨基酸存在保守区. 选取AlpA的C-端结构基因序列作为引物进行PCR, 将PCR产物定向插入载体pET-22b(+), 以DNA自动分析仪进行序列测定, 并以生物信息学软件分析其生物学特性.结果克隆片段的长度为588 bp, 与发表的黏附素AlpA保守区基因的序列完全一致.ANTHEPROT V4.3c软件预测其蛋白质的Mr约为22 500, 并显示出良好的抗原性和疏水性.结论用PCR方法, 从幽门螺杆菌ss1中获取到黏附素AlpA保守区的基因序列, 为研究Hp黏附素的分子机制和免疫原性奠定了基础.