目的 利用生物信息学技术探究1/17型辅助 T(Th/17)细胞的功能及其分化过程.方法 采用高通量基因表达数据库(GEO)中包含来源于健康人体Th17 细胞和Th1/17细胞基因表达数据的基因芯片数据集(GSE104021)进行生物信息学分析.以Th17细胞为对照,采用R语言软件分析Th17细胞和Th1/17细胞之间的差异表达基因,以此探究Th1/17细胞发挥功能的主要效应分子.后通过R语言软件对差异表达基因进行基因本体(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析.最后选用 GO分析中被富集到目标生物过程中的基因,进行蛋白质相互作用网络(PPI)分析,探索Th1/17细胞的分化过程.结果 差异表达基因分析结果显示,与Th17细胞相比,Th1/17细胞中低表达基因为自细胞介素 17A(IL-17 A)和 CC趋化因子受体 4(CCR4);高表达基因为含卷曲螺旋域3(CCDC3)、CC趋化因子配体 4(CCLA)、集落剌激因子 2受体β亚单位(CSF2RB)、CCL5、γ干扰素(IFNG)和上皮基质相互作用分子 1(EPSTIl).GO分析中细胞组分分析结果显示,这些差异基因表达产物主要定位于细胞膜胞外侧和粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子(GM-CSF)受体复合物中;生物过程分析结果显示差异基因表达产物参与上调白细胞介素 23(IL-23)产生,趋化因子介导的信号通路和上调自然杀伤(NK)细胞趋化性;分子功能分析
作者：刘珺；乔丽娟；李积东；许玉珍；永胜；刘燕
来源：细胞与分子免疫学杂志 2019 年 35卷 9期
