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目的 探究藿香正气液(HXZQ)治疗新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease 19,COVID-19)的网络调控机制.方法 通过SymMap、TCMSP数据库筛选药物的归经、有效成分;输入Pharm Mapper数据库、DrugBank数据库、SwissTarget数据库获得相应基因;检索GeneCards数据库获得COVID-19的靶点基因;利用R语言3.6.1截取交集网络获得候选靶点;借助Cytoscape 3.7.1将归经-中药-化合物-靶点-疾病网络进行可视化处理;在STRING平台上构建蛋白-蛋白相互作用(protein-protein interac-tion,PPI)网络并导入Cytoscape 3.7.1完成图像处理;利用DAVID数据库对候选靶点进行GO(gene ontology)富集分析和KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)通路注释;用AutoDock Vina 4.2.6将关键靶点与关键成分进行分子对接,并用PyMol进行可视化处理.结果 获得164种有效化合物、443个不重复的靶标、67个疾病治疗靶点.GO功能富集得到GO条目173个(P<0.05),其中生物过程(biological process,BP)条目126个,细胞组成(cellular component,CC)条目22个,分子功能(molecular function,MF)条目25个;KEGG通路富集得到114条信号通路(P<0.05).结论 藿香正气液中的有效成分槲皮素、β-谷甾醇、柚皮素、汉黄芩苷、山柰酚、2-hydroxyisoxypropyl-3-hydroxy-7-is

作者:顾昱昊;陈可点;戚蕊;卢明军;皮雯敏;谢以清;高丰;戴子琦;吴倩文;霍苏;徐意;徐冰;雷海民

来源:西北药学杂志 2022 年 37卷 2期

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作者:
顾昱昊;陈可点;戚蕊;卢明军;皮雯敏;谢以清;高丰;戴子琦;吴倩文;霍苏;徐意;徐冰;雷海民
来源:
西北药学杂志 2022 年 37卷 2期
标签:
藿香正气液 新型冠状病毒肺炎 作用机制 分子对接
目的 探究藿香正气液(HXZQ)治疗新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease 19,COVID-19)的网络调控机制.方法 通过SymMap、TCMSP数据库筛选药物的归经、有效成分;输入Pharm Mapper数据库、DrugBank数据库、SwissTarget数据库获得相应基因;检索GeneCards数据库获得COVID-19的靶点基因;利用R语言3.6.1截取交集网络获得候选靶点;借助Cytoscape 3.7.1将归经-中药-化合物-靶点-疾病网络进行可视化处理;在STRING平台上构建蛋白-蛋白相互作用(protein-protein interac-tion,PPI)网络并导入Cytoscape 3.7.1完成图像处理;利用DAVID数据库对候选靶点进行GO(gene ontology)富集分析和KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)通路注释;用AutoDock Vina 4.2.6将关键靶点与关键成分进行分子对接,并用PyMol进行可视化处理.结果 获得164种有效化合物、443个不重复的靶标、67个疾病治疗靶点.GO功能富集得到GO条目173个(P<0.05),其中生物过程(biological process,BP)条目126个,细胞组成(cellular component,CC)条目22个,分子功能(molecular function,MF)条目25个;KEGG通路富集得到114条信号通路(P<0.05).结论 藿香正气液中的有效成分槲皮素、β-谷甾醇、柚皮素、汉黄芩苷、山柰酚、2-hydroxyisoxypropyl-3-hydroxy-7-is