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背景:人类白细胞抗原等位基因分型对器官移植和法医鉴定等有重要意义.目前的分型方法难以实现高通量和集成化,准确性和重复性也不理想.目的:比较自行构建的寡核苷酸芯片与序列特异性引物-聚合酶链反应(polymerase chain reaction with sequence-specific primers,PCR-SSP)两种方法用于人类白细胞抗原DQA1基因分型的结果,以评价寡核苷酸芯片的性能.方法:纳入2006-01/2009-03丁中国医科大学附属第一医院血液科门诊就诊的患者100例.分别用等位基因特异的PCR-SSP和自行构建的寡核苷酸芯片对患者的人类白细胞抗原DQA1进行分型.寡核苷酸芯片分型采用荧光标记的组间特异性引物扩增基因组DNA,扩增后的产物与分型芯片的探针杂交,由杂交产生的荧光信号确定人类白细胞抗原DQA1位点基因型.比较两种方法分型所获得的结果,不吻合的样本经第三方测序验证.结果与结论:100例临床样本经寡核苷酸芯片和PCR-SSP分型全部成功.分型结果的吻合率为94

作者:王彤;王天骄;彭莉;王杰

来源:中国组织工程研究与临床康复 2010 年 14卷 44期

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作者:
王彤;王天骄;彭莉;王杰
来源:
中国组织工程研究与临床康复 2010 年 14卷 44期
标签:
人类白细胞抗原DQA1 寡核苷酸芯片 序列特异性引物-聚合酶链反应 基因分型 细胞移植
背景:人类白细胞抗原等位基因分型对器官移植和法医鉴定等有重要意义.目前的分型方法难以实现高通量和集成化,准确性和重复性也不理想.目的:比较自行构建的寡核苷酸芯片与序列特异性引物-聚合酶链反应(polymerase chain reaction with sequence-specific primers,PCR-SSP)两种方法用于人类白细胞抗原DQA1基因分型的结果,以评价寡核苷酸芯片的性能.方法:纳入2006-01/2009-03丁中国医科大学附属第一医院血液科门诊就诊的患者100例.分别用等位基因特异的PCR-SSP和自行构建的寡核苷酸芯片对患者的人类白细胞抗原DQA1进行分型.寡核苷酸芯片分型采用荧光标记的组间特异性引物扩增基因组DNA,扩增后的产物与分型芯片的探针杂交,由杂交产生的荧光信号确定人类白细胞抗原DQA1位点基因型.比较两种方法分型所获得的结果,不吻合的样本经第三方测序验证.结果与结论:100例临床样本经寡核苷酸芯片和PCR-SSP分型全部成功.分型结果的吻合率为94