背景:目前开展HLA-DQB1基因与鼻咽癌疾病相关性研究一方面受昂贵的进口试剂所制约,另一方面单纯做HLA-DQB1第2外测序分型,模棱两可,结果较少.
目的:采用HLA-DQB1基因第2至第3外显子双向测序分型检测技术方法.
方法:纳入286份中国汉族健康人群血液样本,46例鼻咽癌患者样本,使用Gentra DNA提取试剂制备基因组DNA,取100份健康人群样本作为平行对照组进行基因分型,选择及自行设计HLA-DQB1基因第2至3外显子扩增引物及测序引物,探索最适合PCR扩增及测序反应条件.采用商品化HLA-DQB1基因单向测序分型试剂盒作对照.
结果与结论:100份平行对照组样本与HLA-SBT测序分型结果一致.286例健康个体中共检出13种等位基因,27例样本的等位基因为纯合子.鼻咽癌人群共检出DQB1等位基因11种,5例样本的等位基因为纯合子.鼻咽癌患者DQB1*02等位基因频率高于对照组,但所有等位基因频率比较,差异无显著性意义(χ2<3.84,P >0.05).未发现HLA-DQB1基因与鼻咽癌有相关性.说明采用的中国汉族人群HLA-DQB1基因测序分型方法具有操作方便、结果稳定和低成本消耗等优势.
作者：卢亮；吕震
来源：中国组织工程研究 2012 年 33期
