背景:神经嵴细胞发育对中枢神经系统、颅颌面和心脏等组织器官的发生具有重要的作用,受多个基因调控,但各调控基因之间的关系尚不清楚。目的:应用生物信息学方法研究神经嵴细胞发育的分子调控网络。方法:从 GEO 在线数据库获得在神经嵴细胞发生时差异表达明显的500个基因。通过 DAVID 和STRING数据库分析这些基因之间的关系。结果与结论:①从GEO数据获得的在神经嵴发生时差异表达的500个基经DAVID数据库分析后按照一定的共同属性富集在转化生长因子β信号通路、WNT信号通路、同源盒基因、神经嵴细胞分化、神经管发育等不同的“信号通路”、“分子功能”和“生物学过程”子集;②经 STRING 数据库分析后建立了DLX5、MSX2、SNAIL2、PAX7、SHH、SOX9、NOG、GSC、KAL1、骨形态发生蛋白5、成纤维细胞生长因子8和WNT3a等12个基因的分子网络图,这些基因通过共表达、拮抗、激活等彼此关联;③神经嵴细胞发生时许多基因参与了调控,这些基因间存在相互作用并形成网络,提示要从信号通路和分子网络上整体思考神经嵴发育障碍相关疾病的防治。
作者:王君芳;王佳琦;毕庆伟;尹翰文;张国梁
来源:中国组织工程研究 2016 年 20卷 24期