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背景:研究证实,代谢组学可以从一个总体轮廓上对大鼠心肌梗死病理代谢产物进行分析,从全面总体的角度对大鼠心肌梗死机制进行观察。<br>  目的:进一步分析大鼠心肌梗死模型血清代谢组生物信息学通路。<br>  方法:从中国知网、万方数据库、维普数据库、Embase、PubMed数据库中检索大鼠心肌梗死的实验研究。对纳入研究代谢产物进行汇总。信号通路分析采用KEGG,代谢产物分子注释、相关的酶或转运蛋白及其相关性质分析采用HMDB,代谢产物路径可视化采用metPA网络软件。<br>  结果与结论:①共有10篇文献纳入分析,有26个代谢产物在这些文献中重复出现,主要参与了29条代谢路径;②通过通路拓扑分析选出了5条代谢通路作为大鼠心肌梗死代谢通路,分别是:氨酰tRNA生物合成、甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢、缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸的生物合成、不饱和脂肪酸的生物合成、苯丙氨酸,酪氨酸和色氨酸生物合成;③大鼠心肌梗死代谢组生物信息分析显示心肌梗死发病机制涉及到糖类、脂肪、蛋白质、RNA等物质代谢及其代谢通路。

作者:伍新诚;郑景辉;马晓聪;卓小媛;张新春

来源:中国组织工程研究 2017 年 21卷 4期

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作者:
伍新诚;郑景辉;马晓聪;卓小媛;张新春
来源:
中国组织工程研究 2017 年 21卷 4期
标签:
组织构建 组织工程 心肌梗死 代谢组学 生物信息学 国家自然科学基金
背景:研究证实,代谢组学可以从一个总体轮廓上对大鼠心肌梗死病理代谢产物进行分析,从全面总体的角度对大鼠心肌梗死机制进行观察。<br>  目的:进一步分析大鼠心肌梗死模型血清代谢组生物信息学通路。<br>  方法:从中国知网、万方数据库、维普数据库、Embase、PubMed数据库中检索大鼠心肌梗死的实验研究。对纳入研究代谢产物进行汇总。信号通路分析采用KEGG,代谢产物分子注释、相关的酶或转运蛋白及其相关性质分析采用HMDB,代谢产物路径可视化采用metPA网络软件。<br>  结果与结论:①共有10篇文献纳入分析,有26个代谢产物在这些文献中重复出现,主要参与了29条代谢路径;②通过通路拓扑分析选出了5条代谢通路作为大鼠心肌梗死代谢通路,分别是:氨酰tRNA生物合成、甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢、缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸的生物合成、不饱和脂肪酸的生物合成、苯丙氨酸,酪氨酸和色氨酸生物合成;③大鼠心肌梗死代谢组生物信息分析显示心肌梗死发病机制涉及到糖类、脂肪、蛋白质、RNA等物质代谢及其代谢通路。